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Análise integrativa do perfil de expressão de miRNAs-mRNAs obtidos a partir de banco de dados públicos de microarranjos de DNA: influência da Pregnenolona nas atividades das lipoproteínas

Processo: 19/03503-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de abril de 2019
Vigência (Término): 31 de março de 2020
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Farmácia - Análise Toxicológica
Pesquisador responsável:Mario Hiroyuki Hirata
Beneficiário:Vanessa Barbosa Malaquias
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   Biologia molecular   Epigênese genética   RNA mensageiro   MicroRNAs   Pregnenolona   Lipoproteínas

Resumo

Os miRNAs desempenham um papel importante na regulação negativa da expressão de mRNAs ao nível pós-transcricional. Ferramentas de bioinformática, são uteis para elucidação dos mecanismos moleculares associados às interações entre miRNAs-mRNAs alvos através de redes reguladoras transcricionais. No presente estudo, uma análise integrativa será realizada com base em perfis de expressão de miRNAs e mRNAs alvos, obtidos de banco de dados públicos, para compreender a possível contribuição da pregnenolona nos mecanismos moleculares envolvidos na diminuição do colesterol plasmático. O conjunto de dados públicos de mRNA (GSE13688) obtido do Gene Expression Omnibus 2R (GEO2R), fornece os mRNAs diferencialmente expressos entre dietas normocalóricas e hipercalóricas com ou sem administração de Pregnenolona 16 alfa-carbonitrilo, em espécies de camundongos Mus Musculus. Os miRNAs regulatórios dos mRNAs alvos selecionados serão identificados através da plataforma de dados TargetScanMouse 7.2 e miRTarBase. Os mRNAs relacionados à homeostasia do colesterol serão analisados pelo software Ingenuity Pathway Analyses (IPA) integrando com os alvos de miRNAs e potenciais vias metabólicas. Com os resultados espera-se contribuir para compreensão dos mecanismos regulatórios da pregnenolona nos genes relacionados a vias metabólicas do colesterol, bem como propor potenciais biomarcadores fornecendo subsídio para futuros estudos in vitro e in vivo.

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