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Relações filogenéticas e identificação de marcadores para apomixia e espécie-específicos do Grupo Plicatula em genomas poliplóides de Paspalum

Processo: 18/18527-9
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de maio de 2019
Vigência (Término): 31 de agosto de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Vegetal
Pesquisador responsável:Anete Pereira de Souza
Beneficiário:Fernanda Ancelmo de Oliveira
Instituição-sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Assunto(s):Filogenia   Gramíneas forrageiras   Apomixia

Resumo

Paspalum é um importante gênero de gramínea forrageira nativa, de espécies predominantemente poliplóides e apomíticas de grande variabilidade genética e complexidade genômica. Representa um valioso recurso a ser explorado tanto no setor agropecuário como modelo biológico para pesquisa científica. Sobretudo, espécies de Plicatula, grupo botânico taxonomicamente intricado, de espécies promissoras para uso como forrageiras. Recentemente, o grupo UNICAMP-EMBRAPA realizou grandes avanços no conhecimento genético-genômico para algumas espécies não-modelo do gênero, disponibilizando ferramentas e um robusto conjunto de dados de escala genômica (marcadores SSR, transcriptoma e sequenciamento "RAD-seq"). A partir dos dados de RAD-seq, este projeto prevê estudar a variação alélica de SNPs pela estimativa de dosagem alélica para espécies poliploides do grupo Plicatula, visando inferir a relação filogenética e delimitação de suas espécies, além do desenvolvimento de um painel de marcadores moleculares espécie-específicos e associados a apomixia, característica altamente desejável na agricultura. Os resultados gerados e marcadores diagnósticos desenvolvidos beneficiarão o uso desse valioso germoplasma e os programas de melhoramento genético de Paspalum, resultando na diminuição do tempo necessário para o lançamento de novas cultivares e na geração de genótipos com maior valor agregado.