Variação genética de clusters de metabólitos secundários em isolados clínicos de espécies crípticas do complexo Aspergillus fumigatus (seção Fumigati)

• Processo: 19/07526-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de abril de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Gustavo Henrique Goldman
• Beneficiário: Renato Augusto Corrêa dos Santos
• Supervisor: Antonios Rokas
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Vanderbilt University (VU), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 17/21983-3 - Análise genômica de espécies crípticas de Aspergillus, BP.DR
• Assunto(s): Genômica Aspergillus Metabólitos secundários Espécies crípticas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aspergillus | Espécies crípticas | Genômica | metabólitos secundários | Genômica

Resumo

Aspergillus fumigatus é um importante patógeno humano. Diversas outras espécies que são geneticamente distintas mas morfologicamente idênticas a A. fumigatus também podem causar infecção em humanos. Estas espécies "crípticas" são de crescente preocupação global devida à ocorrência clínica e crescente resistência a antifúngicos quando comparado com A. fumigatus. Análises prévias de patogenicidade entre espécies próximas revelaram grandes diferenças em clusters gênicos de metabólitos secundários, embora os genomas sejam muito similares, destacando as altas taxas evolutivas destes clusters, o que pode contribuir para as diferenças fenotípicas. A proposta atual de estágio em pesquisa no exterior - doutorado no laboratório do Dr. Antonios Rokas, na Vanderbilt University, tem como objetivo analisar clusters de metabólitos secundários em genomas de isolados clínicos de espécies "crípticas" do complexo A. fumigatus - Fumigati, incluindo (i) SNPs e polimorfismos do tipo indel, conteúdo de genes, perda completa de clusters, idiomórficos, de polimorfismos de localição genômica. Uma visão geral da conservação de clusters de metabólitos secundários será também apresentada baseada em análise de ortologia. A caracterização de clusters de genes de metabólitos secundários em espécies crípticas contribuirá de forma significativa no conhecimento sobre estes importantes patógenos fúngicos e a possível relação entre o repertório de clusters gênicos de metabólitos secundários e o fenótipo.

Publicações científicas

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

STEENWYK, JACOB L.; MEAD, MATTHEW E.; DE CASTRO, PATRICIA ALVES; VALERO, CLARA; DAMASIO, ANDRE; DOS SANTOS, RENATO A. C.; LABELLA, ABIGAIL L.; LI, YUANNING; KNOWLES, SONJA L.; RAJA, HUZEFA A.; et al. Genomic and Phenotypic Analysis of COVID-19-Associated Pulmonary Aspergillosis Isolates of Aspergillus fumigatus. MICROBIOLOGY SPECTRUM, v. 9, n. 1, SEP 2021. (19/07526-4, 17/21983-3, 18/00715-3)

ZUVANOV, LUIZA; BASSO GARCIA, ANA LETYCIA; CORRER, FERNANDO HENRIQUE; BIZARRIA JR, RODOLFO; DA COSTA FILHO, AILTON PEREIRA; DA COSTA, ALISSON HAYASI; THOMAZ, ANDREA T.; MENDES PINHEIRO, ANA LUCIA; RIANO-PACHON, DIEGO MAURICIO; WINCK, FLAVIA VISCHI; et al. he experience of teaching introductory programming skills to bioscientists in Brazi. PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY, v. 17, n. 11, NOV 2021. (17/21983-3, 19/10727-1, 15/03541-8, 20/02084-0, 19/24412-2, 17/10373-0, 19/07526-4, 20/04437-8)

CORREA DOS SANTOS, RENATO AUGUSTO; RIVERO-MENENDEZ, OLGA; STEENWYK, JACOB L.; MEAD, MATTHEW E.; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE; ALASTRUEY-IZQUIERDO, ANA; ROKAS, ANTONIS. Draft Genome Sequences of Four Aspergillus Section Fumigati Clinical Strains. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS, v. 9, n. 40, OCT 2020. (17/21983-3, 16/07870-9, 19/07526-4)

DOS SANTOS, RENATO AUGUSTO CORREA; MEAD, MATTHEW E.; STEENWYK, JACOB L.; RIVERO-MENENDEZ, OLGA; ALASTRUEY-IZQUIERDO, ANA; GOLDMAN, GUSTAVO HENRIQUE; ROKAS, ANTONIS. Examining Signatures of Natural Selection in Antifungal Resistance Genes Across Aspergillus Fungi. FRONTIERS IN FUNGAL BIOLOGY, v. 2, p. 12-pg., 2021-09-10. (17/21983-3, 16/07870-9, 19/07526-4)