Avaliação prospectiva do uso do sequenciamento exômico na investigação etiológica de pacientes sindrômicos com baixa estatura sem diagnóstico clínico

• Processo: 18/10893-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de julho de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Alexander Augusto de Lima Jorge
• Beneficiário: Bruna Lucheze Freire
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/03236-5 - Novas abordagens e metodologias na investigação genético-molecular dos distúrbios de crescimento e desenvolvimento puberal, AP.TEM
• Assunto(s): Endocrinologia Estatura Insuficiência de crescimento Sequenciamento completo do exoma Técnicas de diagnóstico molecular Aconselhamento genético
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: aconselhamento genético | Baixa estatura sindrômica | Diagnóstico Molecular | Plataforma de telemedicina | sequenciamento exomico | Endocrinologia

Resumo

O termo síndrome é utilizado para definir um conjunto de características, sinais e sintomas que estão associados a uma condição. A baixa estatura é uma das principais características encontradas em diversas síndromes conhecidas, e quando associada a outros sinais como, dimorfismos faciais significantes, malformações maiores (ex: agenesia renal, defeito de linha média, defeitos cardíacos graves, malformações do SNC), ADNPM e/ou déficit intelectual, classificamos como baixa estatura sindrômica, que frequentemente é resultado de um defeito genético. Como a maioria das síndromes genéticas relacionadas com distúrbio de crescimento são doenças raras e/ou fenotipicamente heterogêneas, o diagnóstico clínico é um grande desafio, tornando o diagnóstico molecular importante para decisão terapêutica, além do aconselhamento genético da família. O objetivo do presente projeto é estudar a etiologia molecular de pacientes com baixa estatura sindrômica sem diagnóstico clínico, através do sequenciamento exômico (n=50). Desta forma esperamos identificar novos genes responsáveis pela baixa estatura sindrômica e expandir o fenótipo associado a genes já implicados em baixa estatura sindrômica por descrição de casos atípicos. Para tanto, pretendemos desenvolver estratégias para investigação clínica desses pacientes e desenvolver e implementar uma plataforma de telemedicina para avaliação de pacientes com distúrbio de crescimento sindrômico. Utilizaremos do sistema Sure Select da AgilentTC para o preparo das bibliotecas de exoma. A análise de bioinformática dos dados seguirá um fluxo estabelecido pelo laboratório, e as variantes encontradas serão analisadas em relação à frequência populacional, local da variante, predisposição de patogenicidade in sílico, compatibilidade da herança, plausibilidade biológica, e posterior segregação em familiares. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FREIRE, BRUNA LUCHEZE; HOMMA, THAIS KATAOKA; LERARIO, ANTONIO MARCONDES; SEO, GO HUN; HAN, HEONJONG; DE ASSIS FUNARI, MARIANA FERREIRA; GOMES, NATHALIA LISBOA; ROSEMBERG, CARLA; VICTORINO KREPISCHI, ANA CRISTINA; VASQUES, GABRIELA DE ANDRADE; et al. High frequency of genetic/epigenetic disorders in short stature children born with very low birth weight. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 188, n. 9, p. 6-pg., 2022-07-06. (18/10893-6, 13/03236-5)

LIN, YUH-CHARN; NICETA, MARCELLO; MUTO, VALENTINA; VONA, BARBARA; PAGNAMENTA, ALISTAIR T.; MAROOFIAN, REZA; BEETZ, CHRISTIAN; VAN DUYVENVOORDE, HERMINE; DENTICI, MARIA LISA; LAUFFER, PETER; et al. SCUBE3 loss-of-function causes a recognizable recessive developmental disorder due to defective bone morphogenetic protein signaling. American Journal of Human Genetics, v. 108, n. 1, p. 115-133, JAN 7 2021. (13/03236-5, 18/10893-6)

MAGRINO, JOSEPH; MUNFORD, VERIDIANA; MARTINS, DAVI JARDIM; HOMMA, THAIS K.; PAGE, BRENDAN; GAUBITZ, CHRISTL; FREIRE, BRUNA L.; LERARIO, ANTONIO M.; VILAR, JULIANA BRANDSTETTER; AMORIN, ANTONIO; et al. A thermosensitive PCNA allele underlies an ataxia- telangiectasia-like disorder. Journal of Biological Chemistry, v. 299, n. 5, p. 16-pg., 2023-04-26. (18/10893-6, 13/03236-5)

HARRIS, SARAH C.; CHONG, KAREN; CHITAYAT, DAVID; GILMORE, KELLY L.; JORGE, ALEXANDER A. L.; FREIRE, BRUNA L.; LERARIO, ANTONIO; SHANNON, PATRICK; COPE, HEIDI; GALLENTINE, WILLIAM B.; et al. Diagnosis of TBC1D32-associated conditions: Expanding the phenotypic spectrum of a complex ciliopathy. AMERICAN JOURNAL OF MEDICAL GENETICS PART A, v. 191, n. 5, p. 11-pg., 2023-02-24. (18/10893-6, 13/03236-5)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

FREIRE, Bruna Lucheze. O sequenciamento completo do exoma deve ser a primeira abordagem genético-molecular para crianças com baixa estatura sindrômica sem diagnóstico clínico. 2021. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Faculdade de Medicina (FM/SBD) São Paulo.