Descoberta de candidatos antivirais baseados na estrutura da enzima NS5 RNA polimerase RNA-dependente do vírus da febre amarela

• Processo: 18/25773-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Farmacologia - Farmacologia Bioquímica e Molecular
• Pesquisador responsável: Glaucius Oliva
• Beneficiário: Victor Gawriljuk Ferraro Oliveira
• Instituição Sede: Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos, AP.CEPID
• Bolsa(s) vinculada(s): 19/25407-2 - Desenvolvimento de modelos de aprendizado de máquina para a descoberta de novos compostos antivirais contra o vírus da febre amarela, BE.EP.MS
• Assunto(s): Cristalografia Vírus da febre amarela Flavivirus Febre amarela Vacina contra febre amarela Desenvolvimento de fármacos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cristalografia | Febre amarela | Ns5 | planejamento baseado na estrutura | RNA polimerase RNA-dependente | Cristalografia

Resumo

Durante os últimos dois anos o Brasil voltou a apresentar surtos de febre amarela próximos a grandes centros urbanos. Os surtos levaram o Ministério da Saúde a um estado de alerta devido ao grande perigo de uma reurbanização da doença, que não ocorre a mais de setenta anos no país. Uma campanha em massa foi realizada a fim de vacinar a população e controlar a presença do vírus na região, uma vez que o único método profilático da doença é a vacina de vírus atenuado 17D. A falta de um tratamento para a febre amarela, assim como para outras infecções semelhantes, p.ex. Zika e Dengue, evidenciam o perigo dos flavivirus para a saúde pública. Dentre os métodos disponíveis para a seleção de novos fármacos está o planejamento baseado na estrutura do receptor (SBDD). Com base na estrutura tridimensional de proteínas-alvo validadas, este método utiliza diversas técnicas computacionais, sempre integradas com métodos experimentais de síntese e avaliação dos compostos planejados, e tem sido cada vez mais utilizada para o desenvolvimento de novos fármacos. O vírus da febre amarela é um membro da família Flaviviridae, com genoma constituído por uma única fita positiva de RNA que codifica por três proteínas estruturais e outras sete não estruturais. A proteína não-estrutural NS5 do vírus da febre amarela contém dois domínios que desempenham funções centrais para a replicação do RNA viral na célula infectada: um domínio tipo RNA polimerase RNA-dependente (RpRd) e um domínio metiltransferase. O bloqueio específico de qualquer uma destas funções é letal para a replicação viral. O domínio RpRd da NS5 do vírus da febre amarela não possui estrutura cristalográfica conhecida. Neste projeto é proposto a elucidação estrutural do domínio RpRd da NS5 de febre amarela, seguida da procura por ligantes para essa enzima utilizando a estratégia de planejamento baseado na estrutura do receptor. (AU)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

OLIVEIRA, Victor Gawriljuk Ferraro. Descoberta de candidatos antivirais baseados na enzima NS5 RNA polimerase RNA-dependente do vírus da febre amarela. 2021. Dissertação de Mestrado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC/BT) São Carlos.