Montagem de genoma para identificação de genes de resistência a antibióticos em isolados clínicos do Hospital das Clínicas de Ribeirão Preto

• Processo: 19/06672-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
• Pesquisador responsável: Rafael Silva Rocha
• Beneficiário: Murilo Henrique Anzolini Cassiano
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 12/22921-8 - Abordagens de biologia sintética para decifrar os mecanismos de integração de sinais em promotores bacterianos complexos, AP.JP
• Assunto(s): Biologia computacional Resistência a medicamentos Farmacorresistência bacteriana Antibióticos Genoma bacteriano
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genômica | Patogenicidade microbiana | resistencia a antibióticos | Bioinformática

Resumo

A problemática da resistência a antibióticos vem se tornando uma ameaça à saúde mundial. Cada vez mais cria-se uma atmosfera de pressão seletiva nunca presenciada anteriormente pelas bactérias devido tanto ao uso, ou mal-uso, terapêutico dos antibióticos como de toda contaminação ambiental devido a ação antropológica. Sabe-se que os genes que conferem resistência a antibióticos estão tanto nos patógenos como nas bactérias ambientais, evoluindo e disseminando no ambiente. Entender como esse processo ocorre pode ajudar no controle epidemiológico dessa crescente ameaça. Para este entendimento, explorar o complexo conteúdo genético dos patógenos, via sequenciamento e aplicação de ferramentas de bioinformática, faz-se necessário e pode abrir novas possibilidades de informações, o que também pode ser aplicado ao contexto clínico. O foco deste trabalho é montar e analisar genomas bacterianos com diferentes perfis de resistência a antibióticos, isoladas no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, para que se possa identificar genes e mecanismos de resistência presentes no ambiente hospitalar.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BORELLI, TIAGO CABRAL; LOVATE, GABRIEL LENCIONI; SCARANELLO, ANA FLAVIA TONELLI; RIBEIRO, LUCAS FERREIRA; ZARAMELA, LIVIA; PEREIRA-DOS-SANTOS, FELIPE MARCELO; SILVA-ROCHA, RAFAEL; GUAZZARONI, MARIA-EUGENIA. Combining Functional Genomics and Whole-Genome Sequencing to Detect Antibiotic Resistance Genes in Bacterial Strains Co-Occurring Simultaneously in a Brazilian Hospital. ANTIBIOTICS-BASEL, v. 10, n. 4, APR 2021. (19/00390-0, 15/04309-1, 19/06672-7, 16/18827-7, 19/15675-0, 18/18158-3)

ANZOLINI CASSIANO, MURILO HENRIQUE; SILVA-ROCHA, RAFAEL. Benchmarking Bacterial Promoter Prediction Tools: Potentialities and Limitations. MSYSTEMS, v. 5, n. 4, p. 16-pg., 2020-07-01. (19/15675-0, 19/06672-7, 12/22921-8)