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Identificação de eventos de recombinação em bovinos Nelore

Processo: 19/10123-9
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Mestrado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2019
Vigência (Término): 30 de abril de 2020
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Lucia Galvão de Albuquerque
Beneficiário:Patrícia Iana Schmidt
Supervisor no Exterior: Li Ma
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Maryland, College Park, Estados Unidos  
Vinculado à bolsa:18/17812-1 - Identificação de candidatos a haplótipos letais em bovinos Nelore, BP.MS
Assunto(s):Recombinação genética

Resumo

A recombinação é um processo biológico fundamental no qual os materiais genéticos parentais são trocados durante a meiose do óvulo ou espermatozóide; Além disso, falhas na recombinação podem levar a um resultado potencialmente deletério, como aneuploidia. Os objetivos do presente estudo são identificar eventos de recombinação em bovinos Nelore machos e fêmeas e, através de análises funcionais, identificar genes candidatos deletérios localizados em regiões de baixa recombinação. Um total de 4.669 animais foram genotipados com um painel de alta densidade contendo 777.962 marcadores SNP e 4.094 com um painel contendo 70.000 marcadores, que serão imputados ao painel HD usando o software findhap.f90. As taxas de recombinação serão medidas por um método indireto usando pedigree. Para construir mapas de recombinação, a taxa de recombinação entre SNPs consecutivos como o número médio de cruzamentos por meiose será estimada atribuindo-se uniformemente um evento cruzado a todos os intervalos SNP entre dois SNPs informativos. Os dados de recombinação serão divididos por sexo para avaliar os padrões de recombinação em machos e fêmeas, e o teste qui-quadrado será aplicado para determinar se a proporção de eventos cruzados em uma faixa de SNP por meiose é diferente entre os sexos. Para identificar as variantes causais subjacentes às regiões de baixa recombinação, usaremos o software ENSEMBL. Escores SIFT serão usados para classificar mutações como deletérias ou tolerantes. Genes letais durante o desenvolvimento de todos os estágios da vida serão descritos e marcados como genes candidatos. Os resultados deste trabalho fornecerão informações sobre o mecanismo genético e a evolução da recombinação para a raça Nelore.