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Análise integrada do transcriptoma e proteoma para identificação de biomarcadores para eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato em bovinos Caracu

Processo: 19/10438-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Apoio a Jovens Pesquisadores
Vigência (Início): 01 de junho de 2019
Vigência (Término): 31 de maio de 2021
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Nedenia Bonvino Stafuzza
Beneficiário:Nedenia Bonvino Stafuzza
Instituição-sede: Instituto de Zootecnia. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Nova Odessa , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/19216-7 - Análise integrada do transcriptoma e proteoma para identificação de biomarcadores para eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato em bovinos Caracu, AP.JP
Assunto(s):Bos taurus taurus   Análise de sequência de RNA   Proteômica   Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR)

Resumo

Caracu é uma raça taurina adaptada ao clima tropical e subtropical brasileiro que mantém as características de qualidade de carne de um taurino, combinada com a habilidade de se desenvolver eficientemente em qualquer região do Brasil. Desse modo, a raça Caracu apresenta um excelente material genético para auxiliar na elucidação dos mecanismos que controlam características complexas. O projeto proposto tem como objetivo identificar potenciais biomarcadores para estresse térmico, eficiência alimentar e resistência ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus por meio da análise do transcriptoma integrado de sangue periférico e proteínas plasmáticas de animais da raça Caracu. As amostras de RNA serão obtidas a partir de sangue periférico e bibliotecas de RNA total e de miRNA serão construídas e sequenciadas via HiSeq2500. As análises proteômica serão realizadas por eletroforese em gel (SDS-PAGE) e espectrometria de massa (LC-MS/MS). Os genes mais significantes serão validados por PCR em tempo real. A elucidação dos mecanismos que controlam as características de termotolerância e eficiência alimentar, bem como a compreensão dos mecanismos biológicos responsáveis pelas interações vetor-hospedeiro contribuirão para o desenvolvimento de estratégias inovadoras relacionadas a essas características. Este projeto é pioneiro na descrição do transcriptoma integrado e proteoma da raça Caracu, a partir do qual serão identificados genes, novos alelos, RNAs funcionais, transcritos alternativos, polimorfismos, proteínas e novas isoformas que contribuem para as diferenças fenotípicas observadas para cada uma das características estudadas.