Análise integrada do transcriptoma e proteoma para identificação de biomarcadores para eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato em bovinos Caracu

• Processo: 19/10438-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Jovens Pesquisadores
• Data de Início da vigência: 01 de junho de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2024
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Pesquisador responsável: Nedenia Bonvino Stafuzza
• Beneficiário: Nedenia Bonvino Stafuzza
• Instituição Sede: Instituto de Zootecnia. Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). Nova Odessa , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/19216-7 - Análise integrada do transcriptoma e proteoma para identificação de biomarcadores para eficiência alimentar, termotolerância e resistência à carrapato em bovinos Caracu, AP.JP
• Assunto(s): Bos taurus taurus Análise de sequência de RNA Proteômica Reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa quantitativa (qRT-PCR)
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bos taurus taurus | proteômica | qPCR | sequenciamento de RNA | Genômica Animal

Resumo

Caracu é uma raça taurina adaptada ao clima tropical e subtropical brasileiro que mantém as características de qualidade de carne de um taurino, combinada com a habilidade de se desenvolver eficientemente em qualquer região do Brasil. Desse modo, a raça Caracu apresenta um excelente material genético para auxiliar na elucidação dos mecanismos que controlam características complexas. O projeto proposto tem como objetivo identificar potenciais biomarcadores para estresse térmico, eficiência alimentar e resistência ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus por meio da análise do transcriptoma integrado de sangue periférico e proteínas plasmáticas de animais da raça Caracu. As amostras de RNA serão obtidas a partir de sangue periférico e bibliotecas de RNA total e de miRNA serão construídas e sequenciadas via HiSeq2500. As análises proteômica serão realizadas por eletroforese em gel (SDS-PAGE) e espectrometria de massa (LC-MS/MS). Os genes mais significantes serão validados por PCR em tempo real. A elucidação dos mecanismos que controlam as características de termotolerância e eficiência alimentar, bem como a compreensão dos mecanismos biológicos responsáveis pelas interações vetor-hospedeiro contribuirão para o desenvolvimento de estratégias inovadoras relacionadas a essas características. Este projeto é pioneiro na descrição do transcriptoma integrado e proteoma da raça Caracu, a partir do qual serão identificados genes, novos alelos, RNAs funcionais, transcritos alternativos, polimorfismos, proteínas e novas isoformas que contribuem para as diferenças fenotípicas observadas para cada uma das características estudadas.

Publicações científicas

(9)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; DA COSTA E SILVA, ELIANE VIANNA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; CESAR DA COSTA FILHO, LUIZ CARLOS; BARBOSA, FERNANDA BATTISTOTTI; MACEDO, GUSTAVO GUCRINO; LOBO, RAYSILDO B.; BALDI, FERNANDO. Genome-wide association study for age at puberty in young Nelore bulls. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, SEP 2019. (19/10438-0)

VILELA PIRES, BIANCA; DE FREITAS, LUARA AFONSO; VOLTARELI DA SILVA, GABRIELE; BRASIL GARCIA PIMENTA NEVES PEREIRA LIMA, SERGIO; DOS SANTOS GONCALVES CYRILLO, JOSLAINE NOELY; BONVINO STAFUZZA, NEDENIA; PEREIRA DE LIMA, MARIA LUCIA; PARO DE PAZ, CLAUDIA CRISTINA. Influence of calf vigour and suckling assistance from birth to weaning in Guzera beef cattle. ANIMAL PRODUCTION SCIENCE, v. 61, n. 8, MAR 2021. (19/10438-0, 17/50339-5, 18/01540-2)

SILVA, R. P.; ESPIGOLAN, R.; BERTON, M. P.; STAFUZZA, N. B.; SANTOS, F. S.; NEGREIROS, M. P.; SCHUCHMANN, R. K.; RODRIGUEZ, J. D.; LOBO, R. B.; BANCHERO, G.; et al. Genetic parameters and genomic regions associated with calving ease in primiparous Nellore heifers. LIVESTOCK SCIENCE, v. 240, OCT 2020. (18/18921-9, 17/10493-5, 19/10438-0)

PIRES, B. V.; STAFUZZA, N. B.; LIMA, S. B. G. P. N. P.; NEGRAO, J. A.; PAZ, C. C. P.. Differential expression of heat shock protein genes associated with heat stress in Nelore and Caracu beef cattle. LIVESTOCK SCIENCE, v. 230, DEC 2019. (18/19216-7, 19/10438-0, 16/19222-1)

STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; DA COSTA E SILVA, ELIANE VIANNA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; CESAR DA COSTA FILHO, LUIZ CARLOS; BARBOSA, FERNANDA BATTISTOTTI; MACEDO, GUSTAVO GUCRINO; LOBO, RAYSILDO B.; BALDI, FERNANDO. Genome-wide association study for age at puberty in young Nelore bulls. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 137, n. 2, p. 11-pg., 2019-09-12. (19/10438-0)

PIRES, BIANCA VILELA; FREITAS, ANA CLAUDIA; KLEIN, JOHN LENON; DE MELO, THAISE PINTO; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; PARO DE PAZ, CLAUDIA CRISTINA. Meta-analysis and meta-regression of core body temperature in taurine and zebuine cattle under different environmental conditions. LIVESTOCK SCIENCE, v. 265, p. 9-pg., 2022-10-28. (18/19216-7, 16/19222-1, 19/10438-0)

PIRES, BIANCA, V; REOLON, HENRIQUE G.; ABDUCH, NATALYA G.; SOUZA, LUANA L.; SAKAMOTO, LEANDRO S.; MERCADANTE, MARIA EUGENIA Z.; SILVA, RAFAEL M. O.; FRAGOMENI, BRENO O.; BALDI, FERNANDO; PAZ, CLAUDIA C. P.; et al. Effects of Feeding and Drinking Behavior on Performance and Carcass Traits in Beef Cattle. ANIMALS, v. 12, n. 22, p. 15-pg., 2022-11-01. (19/10438-0, 20/03699-9, 19/17251-2, 19/11738-7, 18/19216-7, 18/17313-5)

LIMA, SERGIO B. G. P. N. P.; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; PIRES, BIANCA V.; BONILHA, SARAH F. M.; CYRILLO, JOSLAINE N. S. G.; NEGRAO, JOAO A.; PAZ, CLAUDIA C. P.. Effect of high temperature on physiological parameters of Nelore (Bos taurus indicus) and Caracu (Bos taurus taurus) cattle breeds. TROPICAL ANIMAL HEALTH AND PRODUCTION, v. 52, n. 5, MAR 2020. (18/19216-7, 19/10438-0, 16/19222-1)

OLIVIERI, BIANCA FERREIRA; BRAZ, CAMILA URBANO; LOPES, FERNANDO BRITO; PERIPOLLI, ELISA; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; PEREIRA DA SILVA CORTE, ROSANA RUEGGER; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; CRAVO PEREIRA, ANGELICA SIMONE; STAFUZZA, NEDENIA BONVINO; BALDI, FERNANDO. Differentially expressed genes identified through RNA-seq with extreme values of principal components for beef fatty acid in Nelore cattle. JOURNAL OF ANIMAL BREEDING AND GENETICS, v. 138, n. 1, MAY 2020. (17/03221-9, 11/21241-0, 16/24084-7, 19/10438-0)