Estudos estruturais e funcionais do complexo NS2B-NS3 protease de febre amarela
- Auxílios pontuais (curta duração)
| Processo: | 18/25600-4 |
| Linha de fomento: | Bolsas no Brasil - Doutorado Direto |
| Vigência (Início): | 01 de junho de 2019 |
| Vigência (Término): | 28 de fevereiro de 2023 |
| Área do conhecimento: | Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular |
| Pesquisador responsável: | Glaucius Oliva |
| Beneficiário: | Gabriela Dias Noske |
| Instituição-sede: | Instituto de Física de São Carlos (IFSC). Universidade de São Paulo (USP). São Carlos , SP, Brasil |
| Vinculado ao auxílio: | 13/07600-3 - CIBFar - Centro de Inovação em Biodiversidade e Fármacos, AP.CEPID |
| Assunto(s): | Cristalografia Vírus da febre amarela Peptídeo hidrolases Antivirais |
Resumo O vírus da Febre Amarela (YFV) tem genoma composto por uma única fita de RNA e pertence ao gênero flavivírus, que inclui Dengue, Zika e Hepatite C. Apesar do histórico da doença, ainda não existe nenhum medicamento para seu tratamento. No Brasil, a doença se mantinha contida com a vacinação, no entanto, um surto recente no início de 2017, recolocou a Febre Amarela como preocupação de saúde pública, com risco de espalhar-se novamente no ambiente urbano. O genoma do YFV codifica uma única poli proteína que contém três proteínas estruturais e sete não estruturais. Dentre as proteínas não estruturais, a NS3 é uma das únicas proteínas virais com função enzimática. A NS3 é constituída por dois domínios: um domínio protease (NS3Pro) e um domínio helicase/NTP-ase (NS3Hel). A NS3 protease age juntamente com a porção C-terminal de outra proteína não estrutural, a NS2B, que auxilia o enovelamento correto da NS3 protease, atuando como cofator e permitindo que esteja em sua forma ativa. O complexo NS2B-NS3Pro cliva a poliproteína imatura, liberando as proteínas formadoras do complexo de replicação viral. Considerando a importância deste complexo no ciclo de replicação viral, é evidente sua relevância como alvo de busca e desenvolvimento de potenciais candidatos antivirais. Atualmente, o planejamento de fármacos baseado na estrutura do receptor (SBDD) tem se tornado um dos mais empregados. Aliando métodos computacionais e experimentais, permite a otimização por complementariedade do ligante e receptor além de reduzir o custo e o tempo da busca por ligantes utilizando a docagem molecular. Sendo assim, o objetivo principal deste projeto é a elucidação da estrutura cristalográfica do complexo NS2B-NS3Pro da linhagem circulante do vírus da Febre Amarela e sua utilização na busca por potenciais candidatos antivirais. Neste projeto, será aplicado o método de SBDD, iniciando com a expressão, purificação, caracterização bioquímica e biofísica e cristalização do complexo NS2B-NS3Pro da linhagem circulante de YFV e suas potenciais implicações no ciclo de replicação viral. Em seguida, realizaremos a busca por inibidores. Os ligantes obtidos serão otimizados baseando-se em critérios de afinidade pelo receptor e especificidade, assim como em parâmetros farmacocinéticos e farmacodinâmicos, tais como permeabilidade e citotoxicidade. Desta forma, pretendemos obter um potencial candidato a fármaco, que possa ser utilizado em testes pré-clínicos e eventualmente em testes clínicos. (AU) | |