Validação de qtl e seleção genômica na resistência ao complexo de percevejo em soja

• Processo: 19/13010-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Vigência (Início): 31 de outubro de 2019
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Agrárias - Agronomia - Fitotecnia
• Pesquisador responsável: José Baldin Pinheiro
• Beneficiário: Emanoel Sanches Martins
• Supervisor: Alexander Edward Lipka
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Local de pesquisa: University of Illinois at Urbana-Champaign, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 18/12399-9 - Mapeamento e estudo da interação QTL por ambiente na resistência da soja ao complexo de percevejo, BP.DR
• Assunto(s): Melhoramento genético vegetal Glycine max
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Glycine max | Plant breeding | Statistical Genetics | Melhoramento Vegetal

Resumo

O objetivo deste projeto é identificar os QTLs envolvidos na resistência ao complexo de percevejo na soja em uma população de linhagens recombinantes endogâmicas (RILs), validar esses QTLs através de um estudo de associação genômica ampla (GWAS) e, finalmente, realizar seleção genômica. Serão utilizadas duas populações: uma população de mapeamento com 256 RILs e controles, desenvolvida a partir do cruzamento entre IAC-100 (resistente) e CD-215 (suscetível); e uma população GWAS, composta de 299 linhagens e controles de um cruzamento multiparental. Serão utilizados dados de cinco safras para a população de RILs, bem como os dados da safra 2018/2019 para a população GWAS. Os experimentos foram conduzidos na Estação Experimental da ESALQ, na cidade de Piracicaba, Estado de São Paulo, Brasil. O delineamento experimental foi uma alfa-látice 10x26 e 16x19 para as populações RIL e GWAS, respectivamente, com três repetições cada. Foram avaliadas nove características associadas à resistência ao complexo percevejo e desempenho agronômico. Para obter os dados genotípicos, foi utilizada a genotipagem por sequenciamento (GBS) para RILs e o SoySNP50K iSelect BeadChip para a população GWAS. Na população de RILs, os dados fenotípicos serão analisados através de modelos mistos e, posteriormente, mapeamento de QTL através do Mapeamento de Intervalos Múltiplos (Multiple Interval Mapping - MIM), utilizando dados de múltiplos ambientes. O estudo do GWAS será realizado a fim de validar os QTLs encontrados na população de RILs. Finalmente, realizaremos um estudo de seleção genômica usando a abordagem GBLUP.