Seleção natural no cromossomo X de populações humanas

• Processo: 19/11647-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Vigência (Início): 01 de julho de 2019
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2020
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
• Pesquisador responsável: Diogo Meyer
• Beneficiário: Carlos Henrique Passos
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Genética populacional Genômica Seleção natural Cromossomo X Humanos Ploidias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ancestralidade | cromossomo X | Genética de populações | Genômica | Seleção Natural | Genética de Populações

Resumo

Com a crescente disponibilidade de dados genômicos para humanos, tornou-se possível identificar genes sob seleção natural, incluindo aqueles associados a resistência a patógenos, adaptação a clima ou a mudanças em dietas. Entretanto, tais estudos de seleção têm priorizado autossomos, com os efeitos da seleção sobre o cromossomo X permanecendo pouco estudados. O cromossomo X possui um enriquecimento para genes relacionados à fertilidade, a funções neurológicas, e com associação a doenças, incluindo algumas degenerativas e formas de câncer. Além disso, mutações no cromossomo X são expostas de imediato ao crivo da seleção natural, quando presentes em hemizigose nos homens. Em conjunto, essas características tornam o cromossomo X um importante alvo para estudos a respeito da seleção no genoma humano. Nosso objetivo neste projeto é estudar a ação da seleção natural que ocorre em diferentes escalas temporais no cromossomo X, sendo elas: (I) seleção contemporânea, ocorrendo na geração atual; (II) seleção recente, ocorrendo há centenas de anos, a partir do início da miscigenação entre europeus, africanos e indígenas na origem de brasileiros; e (III) seleção intermediária, ocorrendo há milhares de anos, gerando diferenças entre populações presentes em diferentes continentes. Nossas estratégias analíticas para detectar seleção são: (I) comparação da frequência de SNPs entre homens e mulheres (seleção contemporânea); (II) detecção de regiões do genoma com desvios nas proporções de ancestralidade (seleção recente); e (III) detecção de regiões com SNPs que apresentam diferenciação extrema, medida usando Fst (seleção intermediária). Esperamos, com esse estudo, compreender o papel da ploidia na modulação da intensidade e dinâmica da seleção natural; identificar novos alvos da seleção em humanos; compreender como a seleção natural (assim como nossa capacidade de detectá-la) difere conforme a escala temporal investigada.