Papel de lncRNAs e de redes regulatórias envolvendo lncRNAs, miRNAs e mRNAs na progressão do Melanoma

• Processo: 19/05641-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Vigência (Início): 01 de agosto de 2019
• Vigência (Término): 30 de setembro de 2022
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Farmacologia - Farmacologia Bioquímica e Molecular
• Pesquisador responsável: Miriam Galvonas Jasiulionis
• Beneficiário: Ana Luisa Pedroso Ayub
• Instituição Sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Epigênese genética RNA longo não codificante MicroRNAs RNA mensageiro Progressão da doença Melanoma Análise de sequência de RNA
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: epigenética | lncRNAs | melanoma | miRNAs | progressão tumora | RNA não codificantes | Epigenetica

Resumo

Estima-se que cerca de 90% do genoma seja transcrito em RNA não codificante (ncRNA). Os ncRNAs podem ser classificados em pequenos (como os miRNAs) e longos (lncRNA), e ambos já foram reportados atuando em processos biológicos como proliferação, diferenciação e migração celular. As alterações em sua expressão vêm sendo associadas com diversas doenças, incluindo o Câncer. Além disso, estudos recentes demonstram que lncRNAs podem regular a maquinaria epigenética através do silenciamento ou remodelamento da cromatina, regulação do splicing, recrutamento de fatores de transcrição e regulação da estabilidade do mRNA. Os lncRNAs também podem regular e ser regulados por miRNAs. O Melanoma é um dos tipos mais agressivos de Câncer, apresentando alta probabilidade de metástase e resistência a terapias. Nosso laboratório desenvolveu um modelo de progressão do Melanoma, onde diferentes linhagens celulares representando etapas distintas da progressão foram estabelecidas após submeter melanócitos não tumorigênicos à condição sustentada de estresse celular (bloqueios sequenciais de adesão). O objetivo deste trabalho é identificar lncRNAs envolvidos na progressão do Melanoma e elucidar os mecanismos pelos quais exercem suas funções, através de análises integradas dos dados de RNA-seq e arrays de expressão de miRNAs, visando identificar possíveis vias de lncRNAs com miRNAs e mRNAs que estejam relacionadas com a progressão do Melanoma. Dados prévios da comparação do resultado do sequenciamento de RNA das 4 linhagens deste modelo (melan-a, melanócitos não tumorigênicos; 4C, melanócitos pré-malignos; 4C11-, células de Melanoma não metastático; 4C11+, células de Melanoma metastático), identificaram um total de 3032 genes codificantes e não codificantes que apresentaram expressão diferenciada entre duas ou mais linhagens celulares, dos quais 5 genes, 1 codificante e 4 não codificantes, foram previamente selecionados para este trabalho. Os lncRNAs identificados neste projeto serão validados através de testes funcionais in vitro e ensaio de tumorigenicidade in vivo. Estes resultados poderão servir de base para novas formas de prognóstico, diagnóstico e terapia do Melanoma, além de contribuir com o entendimento do papel de lncRNAs na gênese e progressão do Melanoma. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

PESSOA, DIOGO DE OLIVEIRA; RIUS, FLAVIA EICHEMBERGER; ANGELO PAPAIZ, DEBORA D.; PEDROSO AYUB, ANA LUISA; MORAIS, ALICE SANTANA; DE SOUZA, CAMILA FERREIRA; DA PAIXAO, VINICIUS FERREIRA; SETUBAL, JOAO CARLOS; NEWTON-BISHOP, JULIA; NSENGIMANA, JEREMIE; et al. Transcriptional signatures underlying dynamic phenotypic switching and novel disease biomarkers in a linear cellular model of melanoma progression. Neoplasia, v. 23, n. 4, p. 439-455, APR 2021. (17/25321-5, 19/05641-0, 09/51462-9, 18/20775-0, 14/01168-5, 11/18959-7, 14/13663-0)

BATTAGELLO, DANIELLA S.; DRAGUNAS, GUILHERME; KLEIN, MARIANNE O.; AYUB, ANA L. P.; VELLOSO, FERNANDO J.; CORREA, RICARDO G.. Unpuzzling COVID-19: tissue-related signaling pathways associated with SARS-CoV-2 infection and transmission. Clinical Science, v. 134, n. 16, p. 2137-2160, AUG 2020. (17/17998-5, 17/16549-2, 19/05641-0)