Abordagens de biologia de sistemas para estudo de vias de sinalização por RNA-seq em linhagens celulares de câncer de mama triplo-negativo

• Processo: 19/03893-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2019
• Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2020
• Área de conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Milton Yutaka Nishiyama Junior
• Beneficiário: Marco Lazaro de Sousa Batista
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 16/05311-2 - Medicina regenerativa visando à terapia de doenças crônico-degenerativas (câncer e diabetes), AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Biologia de sistemas Neoplasias mamárias Análise de sequência de DNA Transdução de sinais
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Biologia Computacional | Câncer de mama | Cd90 | Egfr | RNA-seq | vias de sinalização | Biologia de Sistemas

Resumo

O carcinoma mamário é o tipo de câncer mais diagnosticado entre as mulheres, sendo o ductal-invasivo triplo-negativo o mais agressivo e o de pior prognóstico. Devido à falta de alvos moleculares, o tratamento de pacientes apresentando esse fenótipo representa um grande desafio, exigindo estudos mais amplos para melhor compreender a Biologia deste tipo tumoral e para o desenvolvimento de novas estratégias terapêuticas. Estes estudos vêm sendo, realizados pelo grupo da Profa. Dra. Mari Cleide Sogayar, na tentativa de se encontrar novos alvos moleculares de interesse clínico. Com este intuito, o marcador de células-tronco CD90 foi identificado no laboratório como sendo um alvo promissor no câncer de mama, uma vez que foi associado com o mau prognóstico de pacientes e com diversos processos celulares que levam à transformação maligna, tais como: alteração morfológica (transição epitélio-mesênquima), aumento da proliferação celular, invasividade, metástase e ativação da via do EGFR[15]. A avaliação para diferentes métodos de seleção de genes diferencialmente expressos e abordagens para enriquecimento de vias, com o desenvolvimento de uma nova metodologia para integração destes métodos para a elucidação da via de sinalização do CD90 e a sua relação com a via do EGFR na regulação da expressão gênica e relação com outras vias e processos biológicos constitui o objetivo central do presente projeto. Sendo desenvolvido através de um enfoque multidisciplinar envolvendo Biologia de Sistemas e Bioinformática, conjugadas às tecnologias convencionais de Biologia Celular e Molecular. O conhecimento gerado neste trabalho deverá contribuir não só para o entendimento dos mecanismos moleculares subjacentes à origem e progressão do câncer de mama, mas, também, para a identificação de alvos moleculares.