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Análise de diversidade filogenética e funcional do microbioma de espécies de Vellozia vivendo em microhabitats com diferentes disponibilidades nutricionais

Processo: 19/19543-0
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de outubro de 2019
Vigência (Término): 30 de setembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
Pesquisador responsável:Paulo Arruda
Beneficiário:Gisele Antoniazzi Cardoso
Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
Empresa Sede:Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG)
Vinculado ao auxílio:16/23218-0 - Centro de Pesquisa em Genômica Aplicada às Mudanças Climáticas, AP.PCPE
Assunto(s):Biologia computacional   Biotecnologia de plantas   Microbiota   Estresse ambiental   Transcriptoma
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:metagenomics | metatranscriptomics | Bioinformática

Resumo

A bolsista a ser contratada para o Centro de Pesquisa em Genômica Aplicada às Mudanças Climáticas (GCCRC) dará suporte às atividades de bioinformática desenvolvidas nos projetos de pesquisa na área de microbioma, cujo objetivo central é a investigação de micro-organismos promotores de tolerância à stress em plantas. Através do estudo avançado em bioinformática e genômica, o Centro de Pesquisa em Genômica Aplicada às Mudanças Climáticas (GCCRC) desenvolve pesquisa para o desenvolvimento de ativos biotecnológicos focados no aumento da tolerância das plantas às condições climáticas extremas. Nesse âmbito, o estudo do microbioma de plantas é central para alavancar tecnologias inovadoras que propiciem melhor performance de plantas agrícolas. Uma das linhas de pesquisa do centro compreende investigar o papel do microbioma em promover a tolerância a estresses em espécies nativas brasileiras adaptadas a condições ambientais extremas. Especificamente, o presente plano de atividade para treinamento técnico nível TT5 dará suporte as análises de dados de metatranscriptoma e transcriptoma vegetal de espécies nativas dos campos rupestres vivendo em condições contrastantes de disponibilidade nutricional. Objetiva-se que a candidata auxilie no estabelecimento do pipeline de análise de dados de RNAseq, bem como na investigação dos genes e vias metabólicos envolvidos na tolerância ao stress dessas plantas. Espera-se que os dados gerados por esse projeto sejam traduzidos em soluções agrícolas por meio do pipeline de pesquisa e desenvolvimento do GCCRC.

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