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Aplicação da bioinformática na análise do genoma e transcriptoma de bovinos Nelore, integrando informações pública

Processo: 19/16732-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de outubro de 2019
Vigência (Término): 30 de setembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Lucia Galvão de Albuquerque
Beneficiário:Larissa Fernanda Simielli Fonseca
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:17/10630-2 - Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore, AP.TEM
Assunto(s):Transcriptoma   Biologia computacional   Bovinos

Resumo

As tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS) aumentam consideravelmente as possibilidades de aplicação de informações moleculares no desenvolvimento de pesquisas científicas, possibilitando a caracterização da variabilidade no genoma de uma espécie e investigação de suas consequências a nível transcricional e fenotípico. Cerca de 100 touros da raça Nelore, escolhidos devido à contribuição no rebanho nacional, terão o genoma completo sequenciado e alinhado com a sequência de referência bovina UMD 3.1, para o desenvolvimento do projeto Temático "Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore". Este projeto temático também irá realizar o sequenciamento de RNA total extraído dos tecidos muscular e hepático, em grupos de animais Nelore de maior e menor eficiência alimentar. Sabendo-se que conhecimentos de bioinformática serão essenciais para a análise e interpretação de tais informações, o presente projeto visa, primeiramente, assessorar, na área de bioinformática, todos os estudos a serem realizados no referido projeto temático. Além disto, no presente projeto, o sequenciamento completo do genoma e transcriptoma de animais zebuínos da raça Nelore será utilizado para comparações com informações públicas de mesmo caráter, visando analisar o histórico demográfico das subespécies Boas taurus taurus (taurinos) e Bos taurus indicus (zebuínos) e identificar novos transcritos com potencial codificante, expressos em bovinos.