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Diversidade genética e análise de paternidade múltipla em tubarões do gênero Squalus (Chondrichthyes: Squalidae) por meio de SNPs

Processo: 19/15131-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de novembro de 2019
Vigência (Término): 31 de outubro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Claudio de Oliveira
Beneficiário:Beatriz Rochitti Boza
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IBB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Botucatu. Botucatu , SP, Brasil
Assunto(s):Genética populacional   Sequenciamento de nova geração   Genômica   Marcador molecular   Polimorfismo de um único nucleotídeo   Pesca

Resumo

A pesca excessiva impõe mudanças na estratégia de vida das populações dos organismos, especialmente dos elasmobrânquios (tubarões e raias). Assim, compreender a estrutura das populações torna-se uma importante ferramenta de conservação e manejo dos estoques, que requer um amplo conhecimento sobre aspectos genéticos, biogeográficos, de distribuição e ocorrência das espécies. A identificação de estoques geneticamente diferenciados e adaptados ao seu habitat representa um ponto fundamental para o manejo das espécies. O gênero de tubarões Squalus (família Squalidae) é atualmente formado por 26 espécies que são popularmente chamadas de cação-bagre. Este gênero constitui um dos grupos de tubarões mais problemáticos taxonomicamente, devido à grande similaridade morfológica entres as espécies, e, assim, muitos pesquisadores acreditam que neste grupo existam táxons descritos erroneamente. No oceano Atlântico existem cerca de 11 espécies do gênero Squalus; e, no litoral brasileiro, essas espécies nunca foram estudadas geneticamente ou tiveram suas populações analisadas. A escassez de dados e as confusões taxonômicas refletem o atual status na lista vermelha da International Union for Conservation of Nature (IUCN), onde grande parte das espécies de Squalus estão listadas como "dados insuficientes" ou "inexistentes". Neste contexto, o presente trabalho tem como objetivo principal desenvolver marcadores do tipo Single Nucleotide Polymorphism (SNPs) para estudos populacionais nas espécies identificadas, além de análise de paternidade múltipla. Para a realização desta pesquisa contamos com 60 ninhadas, variando de 2 a 12 filhotes/mãe, totalizando 283 amostras distribuídas nas espécies S. cubensis, S. clarkae e S. acanthias e obtidas de diferentes localidades na costa da Argentina e Brasil. As amostras foram armazenadas em frascos com etanol 95% para posterior realização das etapas de extração de DNA e identificação e análise dos SNPs, obtidos com sequenciamento de nova geração (NGS), para testar hipóteses sobre relações interpopulacionais (incluindo isolamento) e paternidade múltipla. Com esses dados pretendemos contribuir para o conhecimento da diversidade e conservação dos tubarões cação-bagre no oceano Atlântico. (AU)