Análise temporal da expressão gênica

• Processo: 19/23343-7
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de dezembro de 2019
• Vigência (Término): 31 de janeiro de 2023
• Área do conhecimento: Interdisciplinar
• Pesquisador responsável: Roberto Marcondes Cesar Junior
• Beneficiário: Daniel Santa Cruz Damineli
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 15/22308-2 - Representações intermediárias em Ciência Computacional para descoberta de conhecimento, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Biologia de sistemas Análise de séries temporais Expressão gênica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: intermediate network representations | systems biology | Time series analysis | Biologia Computacional

Resumo

O Laboratório de Genômica Pediátrica do Departamento de Pediatria da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (FMUSP) oferece uma posição de pós-doutorado para cientistas interessados na análise temporal da expressão gênica. O foco do projeto é na análise de séries temporais de expressão gênica para melhor compreender as propriedades dinâmicas dos sistemas biológicos, particularmente nos processos de transição saúde-doença. Especificamente, o bolsista participará de dois projetos: i) desenvolvimento de modelos matemático-computacionais para a investigação das alterações da expressão gênica no hipocampo de ratos submetidos a insulto hipertérmico (modelo animal de Epilepsia induzida por insulto febril); ii) estudo temporal das alterações da expressão gênica em enterócitos humanos durante a interação in vitro com bactérias enteropatogênicas. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

HOFFMANN, ROBERT D.; PORTES, MARIA TERESA; OLSEN, LENE IRENE; DAMINELI, DANIEL SANTA CRUZ; HAYASHI, MAKI; NUNES, CUSTODIO O.; PEDERSEN, JESPER T.; LIMA, PEDRO T.; CAMPOS, CLAUDIA; FEIJO, JOSE A.; et al. Plasma membrane H+-ATPases sustain pollen tube growth and fertilization. NATURE COMMUNICATIONS, v. 11, n. 1, MAY 14 2020. (19/23343-7)

PINOTTI, FRANCESCO; WIKRAMARATNA, PAUL S.; OBOLSKI, URI; PATON, ROBERT S.; DAMINELI, DANIEL S. C.; ALCANTARA, LUIZ C. J.; GIOVANETTI, MARTA; GUPTA, SUNETRA; LOURENCO, JOSE. Potential impact of individual exposure histories to endemic human coronaviruses on age-dependent severity of COVID-19. BMC MEDICINE, v. 19, n. 1, JAN 12 2021. (19/23343-7, 20/06160-3)

PORTES, MARIA TERESA; DAMINELI, DANIEL S. C.; FEIJO, JOSE A.. Spatiotemporal Quantification of Cytosolic pH in Arabidopsis Pollen Tubes. BIO-PROTOCOL, v. 11, n. 14, JUL 20 2021. (19/26129-6, 19/23343-7, 15/22308-2, 21/05363-0)

LOURENCO, JOSE; BARROS, SILVIA C.; ZE-ZE, LIBIA; DAMINELI, DANIEL S. C.; GIOVANETTI, MARTA; OSORIO, HUGO C.; AMARO, FATIMA; HENRIQUES, ANA M.; RAMOS, FERNANDA; LUIS, TIAGO; et al. est Nile virus transmission potential in Portuga. COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 5, n. 1, JAN 10 2022. (15/22308-2, 19/23343-7, 20/06160-3)

LI, KUNKUN; PRADA, JUAN; DAMINELI, DANIEL S. C.; LIESE, ANJA; ROMEIS, TINA; DANDEKAR, THOMAS; FEIJO, JOSE A.; HEDRICH, RAINER; KONRAD, KAI ROBERT. An optimized genetically encoded dual reporter for simultaneous ratio imaging of Ca2+ and H+ reveals new insights into ion signaling in plants. NEW PHYTOLOGIST, v. 230, n. 6, FEB 2021. (19/23343-7)