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Metagenômica viral de mosquitos capturados no Estado de São Paulo

Processo: 19/21706-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2019
Vigência (Término): 30 de novembro de 2022
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Convênio/Acordo: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
Pesquisador responsável:Ester Cerdeira Sabino
Beneficiário:Vanessa dos Santos Morais
Instituição-sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/14389-0 - Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (CADDE), AP.TEM
Assunto(s):Doenças transmissíveis   Doenças parasitárias   Metagenômica   Mosquitos   Sequenciamento de nova geração   São Paulo

Resumo

Os vírus de presentes nos insetos hematófagos podem ser divididos em dois grandes grupos: (1) vírus de insetos que infectam os vertebrados (arborvírus; arthropod-borne virus) e (2) vírus de insetos que não os infectam (vírus específicos de insetos). As condições climáticas (clima úmido e quente) e a alta diversidade de espécies de insetos hematófagos no Brasil propiciam condições mais favoráveis a emergência e dispersão dos vírus. Também pode ocorrer a introdução de novos vírus no país, principalmente relacionado a rotas de comércio, turismo ou imigração e, consequentemente, os vetores tornassem aptos para a transmissão de novos patógenos virais, como foi o caso da introdução e dispersão do Zika vírus (ZIKV) recentemente nas Américas. A proposta desse estudo é determinar o conjunto de vírus (viroma) de mosquitos capturados no Estado de São Paulo. Para tanto, nós iremos comparar a diversidade do viroma entre duas localidades que possuem populações de mosquitos teoricamente isoladas geograficamente. O sequenciamento genômica utilizado será o Next-Generation Sequencing (NGS) com a plataforma Illumina. Posteriormente, os contigs gerados serão reunidos com o Sequencher software e avaliados quanto à similaridade genética com outros vírus existentes através do BLASTx. Análises filogenéticas serão realizadas, com os novos vírus identificados, a fim de avaliá-los quanto às suas características evolutivas. Portanto, incentivar o desenvolvimento de pesquisa para compreender os mecanismos evolutivos, emergência e dispersão de vírus presentes em mosquitos é fundamental para prevenir e controlar o aparecimento ou reaparecimento de cepas virais com capacidade de provocar grandes surtos. (AU)

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Publicações científicas (10)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
TINKER, RORY J.; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; TAHMASEBI, ROOZBEH; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; DOS SANTOS MORAIS, VANESSA; PANDEY, RAMENDRA PATI; JOSE-ABREGO, ALEXIS; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; CUNHA, MARIANA SEQUETIN; et al. Norovirus strains in patients with acute gastroenteritis in rural and low-income urban areas in northern Brazil. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 166, n. 3, p. 905-913, . (17/00021-9, 15/12944-9, 16/01735-2, 19/21706-5)
RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; GILL, DANIELLE ELISE; ATHAIDE RIBEIRO, EDCELHA SOARES D.; COSTA MONTEIRO, FRED JULIO; MORAIS, VANESSA S.; MARCATTI, ROBERTA; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S.; ARAUJO, EMERSON LUIZ LIMA; WITKIN, STEVEN S.; VILLANOVA, FABIOLA; et al. Adaptive Evolution of New Variants of Dengue Virus Serotype 1 Genotype V Circulating in the Brazilian Amazon. Viruses-Basel, v. 13, n. 4, . (17/00021-9, 19/21706-5)
FORO RAMOS, ENDRYA DO SOCORRO; ROSA, ULISSES ALVES; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; VILLANOVA, FABIOLA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; BERTANHE, MAYARA; MARCATTI, ROBERTA; ARAUJO, EMERSON LUIZ LIMA; et al. High Heterogeneity of Echoviruses in Brazilian Children with Acute Gastroenteritis. Viruses-Basel, v. 13, n. 4, . (19/21706-5, 17/00021-9, 15/12944-9)
VILLANOVA, FABIOLA; MARCATTI, ROBERTA; BERTANHE, MAYARA; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; LIMA ARAUJO, EMERSON LUIZ; TAHMASEBI, ROOZBEH; WITKIN, STEVEN S.; DENG, XUTAO; et al. New Variants of Squash Mosaic Viruses Detected in Human Fecal Samples. MICROORGANISMS, v. 9, n. 7, . (17/00021-9, 19/21706-5)
TAHMASEBI, ROOZBEH; LUCHS, ADRIANA; TARDY, KAELAN; HEFFORD, PHILIP MICHAEL; TINKER, RORY J.; EILAMI, OWRANG; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; et al. Viral gastroenteritis in Tocantins, Brazil: characterizing the diversity of human adenovirus F through next-generation sequencing and bioinformatics. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, v. 101, n. 12, p. 1280-1288, . (17/00021-9, 19/21706-5)
ADRIANA LUCHS; LAIS SAMPAIO DE AZEVEDO; ELLEN VIANA DE SOUZA; ROBERTA SALZONE MEDEIROS; YASMIN FRANÇA VIANA PIRES DE SOUZA; DALANE LOUDAL FLORENTINO TEIXEIRA; THIAGO FRANCO DE OLIVEIRA CARNEIRO; GABRIELA MARIA FERNANDES DE ALENCAR; FERNANDA LÚCIA DE SOUSA LEITE MORAIS; DIANA DE FÁTIMA ALVES PINTO; et al. Coxsackievirus A6 strains causing an outbreak of hand-foot-and-mouth disease in Northeastern Brazil in 2018. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 64, . (17/00021-9, 20/02469-0, 19/21706-5, 20/11182-6, 20/14786-0)
RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; GILL, DANIELLE ELISE; D'ATHAIDE RIBEIRO, EDCELHA SOARES; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S.; MONTEIRO, FRED JULIO COSTA; VILLANOVA, FABIOLA; NOGUEIRA, JULIANA SILVA; MAEDA, ADRIANA YURIKA; DE SOUZA, RENATO PEREIRA; et al. Guapiacu virus, a new insect-specific flavivirus isolated from two species of Aedes mosquitoes from Brazil. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, . (13/21719-3, 17/00021-9, 16/01735-2, 19/21706-5, 12/23645-4)
LUCHS, ADRIANA; TARDY, KAELAN; TAHMASEBI, ROOZBEH; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; BRUSTULIN, RAFAEL; TELES, MARIA DA APARECIDA RODRIGUES; DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; DE SOUZA, ELLEN VIANA; et al. Human astrovirus types 1, 4 and 5 circulating among children with acute gastroenteritis in a rural Brazilian state, 2010-2016. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 166, n. 11, . (19/21706-5, 15/12944-9, 17/00021-9, 20/11182-6, 20/02469-0, 16/01735-2)
RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; MORAIS, VANESSA S.; COSTA MONTEIRO, FRED JULIO; D'ATHAIDE RIBEIRO, EDCELHA SOARES; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S.; PICANCO SOUTO, RAIMUNDO NONATO; VILLANOVA, FABIOLA; TAHMASEBI, ROOZBEH; HEFFORD, PHILIP MICHAEL; DENG, XUTAO; et al. Aedes aegyptifrom Amazon Basin Harbor High Diversity of Novel Viral Species. Viruses-Basel, v. 12, n. 8, . (16/01735-2, 19/21706-5, 17/00021-9)
MARCELLE SILVA-SALES; ELCIO LEAL; FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA MILAGRES; RAFAEL BRUSTULIN; VANESSA DOS SANTOS MORAIS; ROBERTA MARCATTI; EMERSON LUIZ LIMA ARAÚJO; STEVEN S. WITKIN; XUTAO DENG; ESTER CERDEIRA SABINO; et al. Genomic constellation of human Rotavirus A strains identified in Northern Brazil: a 6-year follow-up (2010-2016). Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 62, . (19/21706-5, 15/12944-9, 17/00021-9)

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