Metagenômica viral de mosquitos capturados no Estado de São Paulo

• Processo: 19/21706-5
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
• Data de Início da vigência: 01 de dezembro de 2019
• Data de Término da vigência: 30 de novembro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Acordo de Cooperação: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
• Pesquisador responsável: Ester Cerdeira Sabino
• Beneficiário: Vanessa dos Santos Morais
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina (FM). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/14389-0 - Centro Conjunto Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (CADDE), AP.TEM
• Assunto(s): Doenças transmissíveis Doenças parasitárias Metagenômica Mosquitos Sequenciamento de nova geração São Paulo
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: metagenômica | Mosquitos | sequenciamento | Doenças infecciosas e parasitárias

Resumo

Os vírus de presentes nos insetos hematófagos podem ser divididos em dois grandes grupos: (1) vírus de insetos que infectam os vertebrados (arborvírus; arthropod-borne virus) e (2) vírus de insetos que não os infectam (vírus específicos de insetos). As condições climáticas (clima úmido e quente) e a alta diversidade de espécies de insetos hematófagos no Brasil propiciam condições mais favoráveis a emergência e dispersão dos vírus. Também pode ocorrer a introdução de novos vírus no país, principalmente relacionado a rotas de comércio, turismo ou imigração e, consequentemente, os vetores tornassem aptos para a transmissão de novos patógenos virais, como foi o caso da introdução e dispersão do Zika vírus (ZIKV) recentemente nas Américas. A proposta desse estudo é determinar o conjunto de vírus (viroma) de mosquitos capturados no Estado de São Paulo. Para tanto, nós iremos comparar a diversidade do viroma entre duas localidades que possuem populações de mosquitos teoricamente isoladas geograficamente. O sequenciamento genômica utilizado será o Next-Generation Sequencing (NGS) com a plataforma Illumina. Posteriormente, os contigs gerados serão reunidos com o Sequencher software e avaliados quanto à similaridade genética com outros vírus existentes através do BLASTx. Análises filogenéticas serão realizadas, com os novos vírus identificados, a fim de avaliá-los quanto às suas características evolutivas. Portanto, incentivar o desenvolvimento de pesquisa para compreender os mecanismos evolutivos, emergência e dispersão de vírus presentes em mosquitos é fundamental para prevenir e controlar o aparecimento ou reaparecimento de cepas virais com capacidade de provocar grandes surtos. (AU)

Publicações científicas

(12)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; MORAIS, VANESSA S.; COSTA MONTEIRO, FRED JULIO; D'ATHAIDE RIBEIRO, EDCELHA SOARES; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S.; PICANCO SOUTO, RAIMUNDO NONATO; VILLANOVA, FABIOLA; TAHMASEBI, ROOZBEH; HEFFORD, PHILIP MICHAEL; DENG, XUTAO; et al. Aedes aegyptifrom Amazon Basin Harbor High Diversity of Novel Viral Species. Viruses-Basel, v. 12, n. 8, AUG 2020. (16/01735-2, 19/21706-5, 17/00021-9)

MARCELLE SILVA-SALES; ELCIO LEAL; FLAVIO AUGUSTO DE PÁDUA MILAGRES; RAFAEL BRUSTULIN; VANESSA DOS SANTOS MORAIS; ROBERTA MARCATTI; EMERSON LUIZ LIMA ARAÚJO; STEVEN S. WITKIN; XUTAO DENG; ESTER CERDEIRA SABINO; et al. Genomic constellation of human Rotavirus A strains identified in Northern Brazil: a 6-year follow-up (2010-2016). Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 62, 2020-12-18. (15/12944-9, 17/00021-9, 19/21706-5)

DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; FRANCA, YASMIN; VIANA, ELLEN; MEDEIROS, ROBERTA SALZONE; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; GUIDUCCI, RAQUEL; RIBEIRO, CIBELE DANIEL; VIEIRA, HELOISA ROSA; BARRIO-NUEVO, KAROLINA MORALES; CUNHA, MARIANA SEQUETIN; et al. Lack of molecular evidence of fecal-borne viruses in capybaras from Sao Paulo state, Brazil, 2018-2020: a minor public health issue. Brazilian Journal of Microbiology, v. N/A, p. 9-pg., 2022-11-07. (20/14786-0, 20/02469-0, 15/12944-9, 20/11182-6, 19/21706-5)

LUCHS, ADRIANA; TARDY, KAELAN; TAHMASEBI, ROOZBEH; MORILLO, SIMONE GUADAGNUCCI; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; BRUSTULIN, RAFAEL; TELES, MARIA DA APARECIDA RODRIGUES; DE AZEVEDO, LAIS SAMPAIO; DE SOUZA, ELLEN VIANA; et al. Human astrovirus types 1, 4 and 5 circulating among children with acute gastroenteritis in a rural Brazilian state, 2010-2016. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 166, n. 11, AUG 2021. (19/21706-5, 15/12944-9, 17/00021-9, 20/11182-6, 20/02469-0, 16/01735-2)

ADRIANA LUCHS; LAIS SAMPAIO DE AZEVEDO; ELLEN VIANA DE SOUZA; ROBERTA SALZONE MEDEIROS; YASMIN FRANÇA VIANA PIRES DE SOUZA; DALANE LOUDAL FLORENTINO TEIXEIRA; THIAGO FRANCO DE OLIVEIRA CARNEIRO; GABRIELA MARIA FERNANDES DE ALENCAR; FERNANDA LÚCIA DE SOUSA LEITE MORAIS; DIANA DE FÁTIMA ALVES PINTO; et al. Coxsackievirus A6 strains causing an outbreak of hand-foot-and-mouth disease in Northeastern Brazil in 2018. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 64, 2022-02-21. (20/02469-0, 17/00021-9, 19/21706-5, 20/14786-0, 20/11182-6)

RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; GILL, DANIELLE ELISE; D'ATHAIDE RIBEIRO, EDCELHA SOARES; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S.; MONTEIRO, FRED JULIO COSTA; VILLANOVA, FABIOLA; NOGUEIRA, JULIANA SILVA; MAEDA, ADRIANA YURIKA; DE SOUZA, RENATO PEREIRA; et al. Guapiacu virus, a new insect-specific flavivirus isolated from two species of Aedes mosquitoes from Brazil. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, FEB 25 2021. (19/21706-5, 13/21719-3, 16/01735-2, 12/23645-4, 17/00021-9)

RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; GILL, DANIELLE ELISE; FORO RAMOS, ENDRYA DO SOCORRO; VILLANOVA, FABIOLA; D'ATHAIDE RIBEIRO, EDCELHA SOARES; COSTA MONTEIRO, FRED JULIO; MORAIS, VANESSA S.; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S.; LIMA ARAUJO, EMERSON LUIZ; PANDEY, RAMENDRA PATI; et al. Chikungunya Virus Asian Lineage Infection in the Amazon Region Is Maintained by Asiatic and Caribbean-Introduced Variants. Viruses-Basel, v. 14, n. 7, p. 14-pg., 2022-07-01. (19/21706-5)

VILLANOVA, FABIOLA; MARCATTI, ROBERTA; BERTANHE, MAYARA; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; LIMA ARAUJO, EMERSON LUIZ; TAHMASEBI, ROOZBEH; WITKIN, STEVEN S.; DENG, XUTAO; et al. New Variants of Squash Mosaic Viruses Detected in Human Fecal Samples. MICROORGANISMS, v. 9, n. 7, JUL 2021. (17/00021-9, 19/21706-5)

TINKER, RORY J.; DA COSTA, ANTONIO CHARLYS; TAHMASEBI, ROOZBEH; MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO DE PADUA; DOS SANTOS MORAIS, VANESSA; PANDEY, RAMENDRA PATI; JOSE-ABREGO, ALEXIS; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; CUNHA, MARIANA SEQUETIN; et al. Norovirus strains in patients with acute gastroenteritis in rural and low-income urban areas in northern Brazil. ARCHIVES OF VIROLOGY, v. 166, n. 3, p. 905-913, MAR 2021. (17/00021-9, 15/12944-9, 16/01735-2, 19/21706-5)

RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; GILL, DANIELLE ELISE; ATHAIDE RIBEIRO, EDCELHA SOARES D.; COSTA MONTEIRO, FRED JULIO; MORAIS, VANESSA S.; MARCATTI, ROBERTA; REGO, MARLISSON OCTAVIO DA S.; ARAUJO, EMERSON LUIZ LIMA; WITKIN, STEVEN S.; VILLANOVA, FABIOLA; et al. Adaptive Evolution of New Variants of Dengue Virus Serotype 1 Genotype V Circulating in the Brazilian Amazon. Viruses-Basel, v. 13, n. 4, APR 2021. (17/00021-9, 19/21706-5)

FORO RAMOS, ENDRYA DO SOCORRO; ROSA, ULISSES ALVES; RIBEIRO, GEOVANI DE OLIVEIRA; VILLANOVA, FABIOLA; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; BERTANHE, MAYARA; MARCATTI, ROBERTA; ARAUJO, EMERSON LUIZ LIMA; et al. High Heterogeneity of Echoviruses in Brazilian Children with Acute Gastroenteritis. Viruses-Basel, v. 13, n. 4, APR 2021. (19/21706-5, 17/00021-9, 15/12944-9)

TAHMASEBI, ROOZBEH; LUCHS, ADRIANA; TARDY, KAELAN; HEFFORD, PHILIP MICHAEL; TINKER, RORY J.; EILAMI, OWRANG; DE PADUA MILAGRES, FLAVIO AUGUSTO; BRUSTULIN, RAFAEL; RODRIGUES TELES, MARIA DA APARECIDA; MORAIS, VANESSA DOS SANTOS; et al. Viral gastroenteritis in Tocantins, Brazil: characterizing the diversity of human adenovirus F through next-generation sequencing and bioinformatics. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, v. 101, n. 12, p. 1280-1288, 2020. (19/21706-5, 17/00021-9)