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Do espécime à sequência: preparação de amostras para sequenciamento utilizando plataforma Illumina

Processo: 19/23665-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2020
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2020
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia - Taxonomia dos Grupos Recentes
Pesquisador responsável:Marcelo Visentini Kitahara
Beneficiário:Ágatha Nascimento Carpinelli
Instituição-sede: Instituto do Mar (IMar). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus Baixada Santista. Santos , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:14/01332-0 - Filogenômica da ordem Scleractinia (Cnidaria, Anthozoa): relações entre evolução da ordem e mudanças climáticas, AP.PFPMCG.JP
Assunto(s):Filogenia molecular   Scleractinia   Métodos analíticos de preparação de amostras   Sequenciamento de nova geração

Resumo

A presente proposta visa treinar um técnico nível TT III em diferentes técnicas empregadas na preparação de amostras, sequenciamento e aquisição de dados em plataformas de sequenciamento Illumina utilizando preparação de bibliotecas TrueSeq para estudos moleculares voltados a filogenômica. As atividades serão divididas em duas etapas: 1) aquisição de dados - focada na extração de DNA genômico de amostras de corais da Ordem Scleractinia, e preparação de bibliotecas para sequenciamento; e 2) técnicas de controle de qualidade e limpeza de sequências. O treinamento tem duração prevista de 24 meses. (AU)