Avaliação do impacto de condições ambientais na diversidade taxonômica e funcional de tecamebas

• Processo: 19/22109-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Vigência (Início): 01 de janeiro de 2020
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia
• Pesquisador responsável: Daniel José Galafasse Lahr
• Beneficiário: Giulia Magri Ribeiro
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 20/15705-3 - Avaliação da importância do metabolismo fermentativo em lagos eutróficos, BE.EP.DR
• Assunto(s): Eucariotos Diversidade Amoeba Arsênio Código de barras de DNA taxonômico Meio ambiente
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Arsênico | Bioindicadores | Diversidade | sequenciamento de nova geração | Tecamebas | tolerância ambiental | Evolução de microrganismo eucariontes

Resumo

As amebas tecadas são microorganismos eucarióticos amebóides que constroem uma carapaça externa (também chamada teca). As amebas tecadas de interesse deste estudo pertencem ao grupo Arcellinida nos amebozoários. Essas amebas tecadas são fáceis de encontrar no ambiente e várias espécies foram documentadas como altamente resistentes ao estresse ambiental. De fato, existe um gradiente de ocorrência de espécies de Arcellinida em ambientes contaminados por arsênico (As). A quantificação da contaminação por arsênico é tecnicamente desafiadora e dispendiosa, pois o arsênico deve ser especiado em suas formas inorgânicas (3+ e 5+). Essa especiação é necessária para a determinação da qualidade ambiental, pois há uma diferença na toxicidade entre as diferentes espécies de arsênico. A caracterização da resistência da ameba tecada ao As será usada para gerar marcadores ambientais de diagnóstico para os níveis de contaminação das formas mais tóxicas sem a necessidade de especiação do arsênico. Este trabalho propõe caracterizar a diversidade de comunidades através de experimentos com metabarcoding em locais contaminados; também nos propomos a caracterizar as vias de resistência ao arsênico em Arcellinida; também propomos comparar a expressão gênica de espécies bioindicadoras em Arcellinida e caracterizaremos o efeito do gradiente de arsênico na morfologia em busca de marcadores. Nossa hipótese é de que a diversidade de Arcellinida será afetada pela contaminação por As e que as espécies mais tolerantes terão um padrão específico de expressão gênica. Este projeto permitirá estabelecer os Arcelininida como modelo para testar hipóteses relacionadas à resistência ao arsênico. Além disso, este projeto também tem o potencial de desenvolver espécies indicadoras para condições ambientais, porque se encontrarmos com o barcoding espécies indicadoras por correlação com a presença de arsênico ou com análise de transcriptoma, demonstramos causalidade da resistência ao arsênico, isso representa uma ferramenta para o diagnóstico de condições ambientais. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

HOFSTATTER, PAULO G.; RIBEIRO, GIULIA M.; PORFIRIO-SOUSA, ALFREDO L.; LAHR, DANIEL J. G.. The Sexual Ancestor of all Eukaryotes: A Defense of the ``Meiosis Toolkit{''} A Rigorous Survey Supports the Obligate Link between Meiosis Machinery and Sexual Recombination. BIOESSAYS, v. 42, n. 9, JUL 2020. (19/22109-0)

RIBEIRO, GIULIA M.; LAHR, DANIEL J. G.. A comparative study indicates vertical inheritance and horizontal gene transfer of arsenic resistance-related genes in eukaryotes. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 173, p. 13-pg., 2022-05-14. (19/22109-0, 13/04585-3)

HOFSTATTER, PAULO G.; RIBEIRO, GIULIA M.; PORFIRIO-SOUSA, ALFREDO L.; LAHR, DANIEL J. G.. The Sexual Ancestor of all Eukaryotes: A Defense of the "Meiosis Toolkit" A Rigorous Survey Supports the Obligate Link between Meiosis Machinery and Sexual Recombination. BIOESSAYS, v. 42, n. 9, p. 10-pg., 2020-07-09. (19/22109-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

RIBEIRO, Giulia Magri. O impacto das condições ambientais na diversidade taxonômica e funcional de amebas tecadas. 2023. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Biociências (IBIOC/SB) São Paulo.