Busca por proteínas associadas à cromatina e padrões de MPTs de histonas associados a estágios celulares e estados metabólicos em tripanossomas

• Processo: 19/21354-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Acordo de Cooperação: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
• Pesquisador responsável: Ariel Mariano Silber
• Beneficiário: Ana Paula de Jesus Menezes
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/14432-3 - Uma rede para uma biologia integrativa em doenças negligenciadas: conectando a epigenética, o metabolismo e a biologia celular em tripanossomatídeos patogênicos, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/08691-1 - Interação entre epigenética, metabolismo e ciclo celular em Trypanosoma cruzi, BE.EP.PD
• Assunto(s): Bioquímica Epigênese genética Metabolismo Trypanosoma Ciclo celular Histonas Proteínas Cromatina
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: ciclo celular | epigenética | leishmania | metabolismo | Trypanosoma | Bioquimica de Parasitas

Resumo

Parasitas submetidos a diferentes contextos metabólicos, como estresse metabólico grave ou condições de estresse metabólico na presença de fontes únicas de carbono e energia para manutenção (PBS suplementado com glicose, prolina, histidina ou leucina) podem ter epigenomos diferentes. Essas diferenças podem afetar o ciclo celular, diferenciação ou invasão de células hospedeiras entre outros processos. Nesta proposta, avaliaremos o epigenoma de parasitas mantidos em diferentes condições metabólicas. Usando um pipeline de ponta para análise de histone PTM, esperamos obter um grande conjunto de dados de medidas quantitativas nos cenários mencionados acima. Os PTMs nas proteínas associadas à cromatina também serão obtidos. Após uma intensa análise de dados, que inclui a integração dos dois conjuntos de dados proteômicos gerados, será possível identificar os principais marcadores epigenéticos associados aos estados metabólicos ou ao ciclo celular. Em seguida, escolheremos alvos para explorar melhor seu papel putativo. Finalmente, a função biológica alvo será explorada avaliando-se: localização genômica, localização celular e dinâmica da expressão. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MENEZES, ANA PAULA; MURILLO, ANA MILENA; DE CASTRO, CAMILA GACHET; BELLINI, NATALIA KARLA; TOSI, LUIZ RICARDO ORSINI; THIEMANN, OTAVIO HENRIQUE; ELIAS, MARIA CAROLINA; SILBER, ARIEL MARIANO; DA CUNHA, JULIA PINHEIRO CHAGAS. Navigating the boundaries between metabolism and epigenetics in trypanosomes. Trends in Parasitology, v. 39, n. 8, p. 14-pg., 2023-08-01. (21/12469-0, 18/14432-3, 18/15553-9, 21/03219-0, 19/21354-1, 20/00694-6)