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Busca por proteínas associadas à cromatina e padrões de MPTs de histonas associados a estágios celulares e estados metabólicos em tripanossomas

Processo: 19/21354-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2020
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
Convênio/Acordo: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
Pesquisador responsável:Ariel Mariano Silber
Beneficiário:Ana Paula de Jesus Menezes
Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/14432-3 - Uma rede para uma biologia integrativa em doenças negligenciadas: conectando a epigenética, o metabolismo e a biologia celular em tripanossomatídeos patogênicos, AP.TEM
Assunto(s):Bioquímica   Epigênese genética   Metabolismo   Trypanosoma   Ciclo celular   Histonas   Proteínas   Cromatina

Resumo

Parasitas submetidos a diferentes contextos metabólicos, como estresse metabólico grave ou condições de estresse metabólico na presença de fontes únicas de carbono e energia para manutenção (PBS suplementado com glicose, prolina, histidina ou leucina) podem ter epigenomos diferentes. Essas diferenças podem afetar o ciclo celular, diferenciação ou invasão de células hospedeiras entre outros processos. Nesta proposta, avaliaremos o epigenoma de parasitas mantidos em diferentes condições metabólicas. Usando um pipeline de ponta para análise de histone PTM, esperamos obter um grande conjunto de dados de medidas quantitativas nos cenários mencionados acima. Os PTMs nas proteínas associadas à cromatina também serão obtidos. Após uma intensa análise de dados, que inclui a integração dos dois conjuntos de dados proteômicos gerados, será possível identificar os principais marcadores epigenéticos associados aos estados metabólicos ou ao ciclo celular. Em seguida, escolheremos alvos para explorar melhor seu papel putativo. Finalmente, a função biológica alvo será explorada avaliando-se: localização genômica, localização celular e dinâmica da expressão. (AU)