Busca por proteínas associadas à cromatina e padrões de MPTs de histonas associados a estágios celulares e estados metabólicos em tripanossomas

• Processo: 19/21354-1
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de janeiro de 2020
• Vigência (Término): 31 de dezembro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Parasitologia - Protozoologia de Parasitos
• Convênio/Acordo: MRC, UKRI ; Newton Fund, com FAPESP como instituição parceira no Brasil
• Pesquisador responsável: Ariel Mariano Silber
• Beneficiário: Ana Paula de Jesus Menezes
• Instituição-sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/14432-3 - Uma rede para uma biologia integrativa em doenças negligenciadas: conectando a epigenética, o metabolismo e a biologia celular em tripanossomatídeos patogênicos, AP.TEM
• Assunto(s): Bioquímica Epigênese genética Metabolismo Trypanosoma Ciclo celular Histonas Proteínas Cromatina

Resumo

Parasitas submetidos a diferentes contextos metabólicos, como estresse metabólico grave ou condições de estresse metabólico na presença de fontes únicas de carbono e energia para manutenção (PBS suplementado com glicose, prolina, histidina ou leucina) podem ter epigenomos diferentes. Essas diferenças podem afetar o ciclo celular, diferenciação ou invasão de células hospedeiras entre outros processos. Nesta proposta, avaliaremos o epigenoma de parasitas mantidos em diferentes condições metabólicas. Usando um pipeline de ponta para análise de histone PTM, esperamos obter um grande conjunto de dados de medidas quantitativas nos cenários mencionados acima. Os PTMs nas proteínas associadas à cromatina também serão obtidos. Após uma intensa análise de dados, que inclui a integração dos dois conjuntos de dados proteômicos gerados, será possível identificar os principais marcadores epigenéticos associados aos estados metabólicos ou ao ciclo celular. Em seguida, escolheremos alvos para explorar melhor seu papel putativo. Finalmente, a função biológica alvo será explorada avaliando-se: localização genômica, localização celular e dinâmica da expressão. (AU)