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Interação genótipo-ambiente em bovinos Nelore para características de crescimento e escores visuais com utilização de dados de sequência

Processo: 19/06361-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de janeiro de 2020
Vigência (Término): 31 de julho de 2022
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Pesquisador responsável:Roberto Carvalheiro
Beneficiário:Ivan Carvalho Filho
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:17/10630-2 - Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore, AP.TEM
Assunto(s):Genômica   Seleção genômica   Interação gene-ambiente   Gado Nelore   Sequenciamento completo do exoma   Estudo de associação genômica ampla

Resumo

A predominância da raça Nelore no Brasil se deve a sua maior capacidade de adaptação, levando a sua criação em grande parte do território brasileiro, o que torna de grande importância as avalições genéticas para esta raça. Porém, nas avaliações genéticas, a interação genótipo-ambiente não é geralmente incorporada no modelo, levando a seleção de animais com potencial genético sub ótimo para determinados ambientes. Os modelos de normas de reação podem ser utilizados para predizer o desempenho animal nos diferentes ambientes e com a inclusão de informações genômicas nos modelos pode-se obter valores genéticos mais acurados, além de levar a descoberta de regiões cromossômicas de efeito maior em determinados ambientes. Assim, objetiva-se avaliar a ocorrência de interação genótipo-ambiente com uso de informações genômicas provenientes de sequenciamento completo do genoma para características de crescimento e de escore corporal e usar essas informações genômicas para analisar as acurácias de predição e realizar estudos de associação genômica. Serão utilizados aproximadamente um milhão de observações fenotípicas de rebanhos distribuídos em diferentes regiões. Aproximadamente sete mil animais foram genotipados com um painel de alta densidade (HD) ou tiveram seus genótipos imputados para o HD e com o sequenciamento completo do genoma de aproximadamente 150 touros, todos os dados genotipados em HD serão imputados para a sequência completa. Os estudos de associação e predição genômica serão conduzidos considerando a metodologia single-step GBLUP e BayesR e a habilidade de predição da seleção genômica será avaliada com a utilização de validação cruzada, do viés e do erro quadrado médio entre os valores preditos e os pseudo-fenótipos. Espera-se que este trabalho ajude na identificação de modelos de normas de reação mais adequados e na identificação e seleção de animais superiores, bem como a identificação de regiões genômicas relacionadas à sensibilidade ambiental, a fim de compreender melhor sua influência sobre a expressão fenotípica. (AU)