Abordagens multi-ômicas para o estudo da doença por Chikungunya

• Processo: 19/24251-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 31 de julho de 2020
• Vigência (Término): 26 de junho de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Microbiologia
• Pesquisador responsável: Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
• Beneficiário: William Marciel de Souza
• Supervisor: Nuno Miguel Rodrigues Pascoal Faria
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Local de pesquisa: University of Oxford, Inglaterra
• Vinculado à bolsa: 17/13981-0 - Caracterização, genômica e diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho, BP.PD
• Assunto(s): Biomarcadores Arbovirus Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Análise multi-ômicas | Arbovírus | biomarcadores | Chikungunya virus | Epidemiologia Genômica | Virologia

Resumo

O vírus Chikungunya (CHIKV) causa infecção aguda e frequentemente associadas à febre e à poliartralgia/poliartrite debilitante. A infecção pelo CHIKV também tem sido associada a alta letalidade em pacientes idosos com condições pré-existentes. Surpreendentemente, mais de 25% das mortes relacionadas ao CHIKV nas Américas foram descritas na cidade de Fortaleza, Ceará, Brasil. Nesse contexto, este projeto tem como objetivo entender os mecanismos evolutivos e de patogênese associados às mortes relacionadas ao CHIKV. Para isso, realizaremos uma abordagem multi-ômics com amostras biológicas de diferentes compartimentos corporais dos pacientes infectados por CHIKV fatais e não fatais, com o objetivo de identificar as principais interações vírus-hospedeiro e biomarcadores subjacentes à gravidade da doença. Conduziremos extensos estudos sobre a diversidade genética do CHIKV nos genomas virais para identificar pressões seletivas e pontos críticos da diversidade de vírus ao longo do genoma que podem estar associados à gravidade da doença. Por fim, criaremos uma central de dados (data-centric) para a visualização de dados genômicos, clínicos e epidemiológicos relacionados à circulação de arbovírus no Brasil. Este estudo esclarecerá os mecanismos subjacentes à gravidade do CHIKV e fornecerá um recurso valioso da comunidade para a análise de dados genômicos, clínicos e epidemiológicos dos arbovírus em circulação no Brasil.

Publicações científicas

(10)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SILVA DE LIMA, SHIRLENE TELMOS; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; CAVALCANTE, JOHN WASHINGTON; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; CARRERA, JEAN-PAUL; SIMOES MELLO, LEDA MARIA; DE CARVALHO ARAUJO, FERNANDA MONTENEGRO; CAVALCANTE RAMALHO, IZABEL LETICIA; DE ALMEIDA BARRETO, FRANCISCA KALLINE; et al. Fatal Outcome of Chikungunya Virus Infection in Brazil. Clinical Infectious Diseases, v. 73, n. 7, p. E2436-E2443, OCT 1 2021. (18/00837-1, 17/13981-0, 18/09383-3, 19/24251-9)

FARIA, NUNO R.; MELLAN, THOMAS A.; WHITTAKER, CHARLES; CLARO, INGRA M.; CANDIDO, DARLAN DA S.; MISHRA, SWAPNIL; CRISPIM, MYUKI A. E.; SALES, FLAVIA C.; HAWRYLUK, IWONA; MCCRONE, JOHN T.; et al. Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science, v. 372, n. 6544, p. 815+, MAY 21 2021. (20/04558-0, 19/21568-1, 19/21301-5, 18/14389-0, 17/13981-0, 20/04272-9, 18/25468-9, 16/18445-7, 19/21858-0, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/07544-2, 18/12579-7, 19/24251-9)

AMORIM, MARIENE R.; SOUZA, WILLIAM M.; BARROS, JR., ANTONIO C. G.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; SIMEONI, CAMILA L.; PARISE, PIERINA L.; VIEIRA, ALINE; FORATO, JULIA; CLARO, INGRA M.; et al. Respiratory Viral Shedding in Healthcare Workers Reinfected with SARS-CoV-2, Brazil, 2020. Emerging Infectious Diseases, v. 27, n. 6, p. 1737-1740, JUN 2021. (20/04558-0, 16/00194-8, 20/02448-2, 18/14389-0, 17/13981-0, 17/26908-0, 19/24251-9, 20/02159-0)

IANI, FELIPE C. M.; GIOVANETTI, MARTA; FONSECA, VAGNER; SOUZA, WILLIAM M.; ADELINO, TALITA E. R.; XAVIER, JOILSON; JESUS, JAQUELINE G.; PEREIRA, MAIRA A.; SILVA, MARCOS V. F.; COSTA, ALANA V. B.; et al. Epidemiology and evolution of Zika virus in Minas Gerais, Southeast Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 91, JUL 2021. (18/14389-0, 17/13981-0, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/24251-9)

DE SOUZA, WILLIAM M.; MURARO, STEFANIE P.; SOUZA, GABRIELA F.; AMORIM, MARIENE R.; SESTI-COSTA, RENATA; MOFATTO, LUCIANA S.; FORATO, JULIA; BARBOSA, PRISCILLA P.; TOLEDO-TEIXEIRA, DANIEL A.; BISPO-DOS-SANTOS, KARINA; et al. lusters of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 Infection after Vaccination with Adenovirus-Vectored and Inactivated Vaccine. Viruses-Basel, v. 13, n. 11, NOV 2021. (16/00194-8, 18/14389-0, 18/13645-3, 17/26908-0, 20/02159-0, 17/13981-0, 19/09704-7, 18/10224-7, 19/24251-9, 20/04558-0)

DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; FUMAGALLI, MARCILIO JORGE; CARRERA, JEAN PAUL; DE ARAUJO, JANSEN; CARDOSO, JEDSON FERREIRA; DE CARVALHO, CRISTIANO; DURIGON, EDISON LUIZ; QUEIROZ, LUZIA HELENA; FARIA, NUNO RODRIGUES; MURCIA, PABLO R.; et al. Paramyxoviruses from neotropical bats suggest a novel genus and nephrotropism. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 95, NOV 2021. (15/05778-5, 19/24251-9, 06/00572-0, 13/14929-1, 18/09383-3, 17/13981-0, 18/14389-0)

DE SOUZA SANTOS, ANDREZA ARUSKA; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; BUSS, LEWIS; LI, SABRINA L.; PEREIRA, RAFAEL H. M.; WU, CHIEH-HSI; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO R.. Dataset on SARS-CoV-2 non-pharmaceutical interventions in Brazilian municipalities. SCIENTIFIC DATA, v. 8, n. 1, MAR 4 2021. (17/13981-0, 19/24251-9, 18/14389-0)

ROMANO, CAMILA MALTA; FELIX, ALVINA CLARA; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; DE JESUS, JAQUELINE GOES; ANDRADE, PAMELA S.; CANDIDO, DARLAN; DE OLIVEIRA, FRANCIANE M.; RIBEIRO, ANDREIA C.; DA SILVA, FRANCINI C.; INEMAMI, MARTA; et al. SARS-CoV-2 reinfection caused by the P.1 lineage in Araraquara city, Sao Paulo State, Brazil. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 63, 2021. (17/13981-0, 19/03859-9, 19/24251-9, 18/14389-0)

CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; et al. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020. (20/04558-0, 16/00194-8, 19/21301-5, 18/14389-0, 18/14933-2, 17/13981-0, 20/04836-0, 18/25468-9, 16/18445-7, 18/09383-3, 18/17176-8, 19/12000-1, 19/07544-2, 19/24251-9)

DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; BUSS, LEWIS FLETCHER; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; CARRERA, JEAN-PAUL; LI, SABRINA; ZAREBSKI, ALEXANDER E.; PEREIRA, RAFAEL HENRIQUE MORAES; PRETE, JR., CARLOS A.; DE SOUZA-SANTOS, ANDREZA ARUSKA; PARAG, KRIS V.; et al. Epidemiological and clinical characteristics of the COVID-19 epidemic in Brazil. NATURE HUMAN BEHAVIOUR, v. 4, n. 8, JUL 2020. (17/13981-0, 19/24251-9, 18/12579-7, 18/14389-0)