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Abordagens multi-ômicas para o estudo da doença por Chikungunya

Processo: 19/24251-9
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 31 de julho de 2020
Vigência (Término): 30 de julho de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Pesquisador responsável:Luiz Tadeu Moraes Figueiredo
Beneficiário:William Marciel de Souza
Supervisor no Exterior: Nuno Miguel Rodrigues Pascoal Faria
Instituição-sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Local de pesquisa: University of Oxford, Inglaterra  
Vinculado à bolsa:17/13981-0 - Caracterização, genômica e diagnóstico de vírus com importância em saúde pública no Brasil por sequenciamento de alto desempenho, BP.PD
Assunto(s):Biomarcadores   Arbovirus   Virologia

Resumo

O vírus Chikungunya (CHIKV) causa infecção aguda e frequentemente associadas à febre e à poliartralgia/poliartrite debilitante. A infecção pelo CHIKV também tem sido associada a alta letalidade em pacientes idosos com condições pré-existentes. Surpreendentemente, mais de 25% das mortes relacionadas ao CHIKV nas Américas foram descritas na cidade de Fortaleza, Ceará, Brasil. Nesse contexto, este projeto tem como objetivo entender os mecanismos evolutivos e de patogênese associados às mortes relacionadas ao CHIKV. Para isso, realizaremos uma abordagem multi-ômics com amostras biológicas de diferentes compartimentos corporais dos pacientes infectados por CHIKV fatais e não fatais, com o objetivo de identificar as principais interações vírus-hospedeiro e biomarcadores subjacentes à gravidade da doença. Conduziremos extensos estudos sobre a diversidade genética do CHIKV nos genomas virais para identificar pressões seletivas e pontos críticos da diversidade de vírus ao longo do genoma que podem estar associados à gravidade da doença. Por fim, criaremos uma central de dados (data-centric) para a visualização de dados genômicos, clínicos e epidemiológicos relacionados à circulação de arbovírus no Brasil. Este estudo esclarecerá os mecanismos subjacentes à gravidade do CHIKV e fornecerá um recurso valioso da comunidade para a análise de dados genômicos, clínicos e epidemiológicos dos arbovírus em circulação no Brasil.

Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre a bolsa::
El riesgo de las mutaciones 
O risco das mutações 
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Publicações científicas (6)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
IANI, FELIPE C. M.; GIOVANETTI, MARTA; FONSECA, VAGNER; SOUZA, WILLIAM M.; ADELINO, TALITA E. R.; XAVIER, JOILSON; JESUS, JAQUELINE G.; PEREIRA, MAIRA A.; SILVA, MARCOS V. F.; COSTA, ALANA V. B.; SILVA, ERNIRIA C.; MENDES, MARCIA C. O.; FILIPPIS, ANA M. B.; ALBUQUERQUE, CARLOS F. C.; ABREU, ANDRE L.; OLIVEIRA, MARLUCE A. A.; ALCANTARA, LUIZ C. J.; FARIA, NUNO R. Epidemiology and evolution of Zika virus in Minas Gerais, Southeast Brazil. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION, v. 91, JUL 2021. Citações Web of Science: 0.
FARIA, NUNO R.; MELLAN, THOMAS A.; WHITTAKER, CHARLES; CLARO, INGRA M.; CANDIDO, DARLAN DA S.; MISHRA, SWAPNIL; CRISPIM, MYUKI A. E.; SALES, FLAVIA C.; HAWRYLUK, IWONA; MCCRONE, JOHN T.; HULSWIT, RUBEN J. G.; FRANCO, LUCAS A. M.; RAMUNDO, MARIANA S.; DE JESUS, JAQUELINE G.; ANDRADE, PAMELA S.; COLETTI, THAIS M.; FERREIRA, GIULIA M.; SILVA, CAMILA A. M.; MANULI, ERIKA R.; PEREIRA, RAFAEL H. M.; PEIXOTO, PEDRO S.; KRAEMER, MORITZ U.; GABURO, JR., NELSON; CAMILO, CECILIA DA C.; HOELTGEBAUM, HENRIQUE; SOUZA, WILLIAM M.; ROCHA, ESMENIA C.; DE SOUZA, LEANDRO M.; DE PINHO, MARIANA C.; ARAUJO, LEONARDO J. T.; MALTA, V, FREDERICO S.; DE LIMA, ALINE B.; SILVA, JOICE DO P.; ZAULI, DANIELLE A. G.; FERREIRA, ALESSANDRO C. DE S.; SCHNEKENBERG, RICARDO P.; LAYDON, DANIEL J.; WALKER, PATRICK G. T.; SCHLUETER, HANNAH M.; DOS SANTOS, ANA L. P.; VIDAL, MARIA S.; DEL CARO, VALENTINA S.; FILHO, ROSINALDO M. F.; DOS SANTOS, HELEM M.; AGUIAR, RENATO S.; PROENCA-MODENA, JOSE L. P.; NELSON, BRUCE; HAY, JAMES A.; MONOD, MELODIE; MISCOURIDOU, XENIA; COUPLAND, HELEN; SONABEND, RAPHAEL; VOLLMER, MICHAELA; GANDY, AXEL; PRETE, JR., CARLOS A.; NASCIMENTO, VITOR H.; SUCHARD, MARC A.; BOWDEN, THOMAS A.; POND, SERGEI L. K.; WU, CHIEH-HSI; RATMANN, OLIVER; FERGUSON, NEIL M.; DYE, CHRISTOPHER; LOMAN, NICK J.; LEMEY, PHILIPPE; RAMBAUT, ANDREW; FRAIJI, NELSON A.; CARVALHO, MARIA DO P. S. S.; PYBUS, OLIVER G.; FLAXMAN, SETH; BHATT, SAMIR; SABINO, ESTER C. Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science, v. 372, n. 6544, p. 815+, MAY 21 2021. Citações Web of Science: 90.
DE SOUZA SANTOS, ANDREZA ARUSKA; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; BUSS, LEWIS; LI, SABRINA L.; PEREIRA, RAFAEL H. M.; WU, CHIEH-HSI; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO R. Dataset on SARS-CoV-2 non-pharmaceutical interventions in Brazilian municipalities. SCIENTIFIC DATA, v. 8, n. 1 MAR 4 2021. Citações Web of Science: 1.
ROMANO, CAMILA MALTA; FELIX, ALVINA CLARA; DE PAULA, ANDERSON VICENTE; DE JESUS, JAQUELINE GOES; ANDRADE, PAMELA S.; CANDIDO, DARLAN; DE OLIVEIRA, FRANCIANE M.; RIBEIRO, ANDREIA C.; DA SILVA, FRANCINI C.; INEMAMI, MARTA; COSTA, ANGELA APARECIDA; LEAL, CIBELE O. D.; FIGUEIREDO, WALTER MANSO; PANNUTI, CLAUDIO SERGIO; DE SOUZA, WILLIAM M.; FARIA, NUNO RODRIGUES; SABINO, ESTER CERDEIRA. SARS-CoV-2 reinfection caused by the P.1 lineage in Araraquara city, Sao Paulo State, Brazil. Revista do Instituto de Medicina Tropical de São Paulo, v. 63, 2021. Citações Web of Science: 0.
CANDIDO, DARLAN S.; CLARO, INGRA M.; DE JESUS, JAQUELINE G.; SOUZA, WILLIAM M.; MOREIRA, FILIPE R. R.; DELLICOUR, SIMON; MELLAN, THOMAS A.; DU PLESSIS, LOUIS; PEREIRA, RAFAEL H. M.; SALES, FLAVIA C. S.; MANULI, ERIKA R.; THEZE, JULIEN; ALMEIDA, LUIZ; MENEZES, MARIANE T.; VOLOCH, CAROLINA M.; FUMAGALLI, MARCILIO J.; COLETTI, THAIS M.; SILVA, CAMILA A. M.; RAMUNDO, MARIANA S.; AMORIM, MARIENE R.; HOELTGEBAUM, HENRIQUE H.; MISHRA, SWAPNIL; GILL, MANDEV S.; CARVALHO, LUIZ M.; BUSS, LEWIS F.; PRETE JR, CARLOS A.; ASHWORTH, JORDAN; NAKAYA, I, HELDER; PEIXOTO, PEDRO S.; BRADY, OLIVER J.; NICHOLLS, SAMUEL M.; TANURI, AMILCAR; ROSSI, ATILA D.; BRAGA, V, CARLOS K.; GERBER, ALEXANDRA L.; GUIMARAES, ANA PAULA DE C.; GABURO JR, NELSON; ALENCAR, CECILA SALETE; FERREIRA, ALESSANDRO C. S.; LIMA, CRISTIANO X.; LEVI, JOSE EDUARDO; GRANATO, CELSO; FERREIRA, GIULIA M.; FRANCISCO JR, RONALDO S.; GRANJA, FABIANA; GARCIA, MARCIA T.; MORETTI, MARIA LUIZA; PERROUD JR, MAURICIO W.; CASTINEIRAS, TEREZINHA M. P. P.; LAZARI, CAROLINA S.; HILL, SARAH C.; DE SOUZA SANTOS, ANDREZA ARUSKA; SIMEONI, CAMILA L.; FORATO, JULIA; SPOSITO, ANDREI C.; SCHREIBER, ANGELICA Z.; SANTOS, MAGNUN N. N.; DE SA, CAMILA ZOLINI; SOUZA, RENAN P.; RESENDE-MOREIRA, LUCIANA C.; TEIXEIRA, MAURO M.; HUBNER, JOSY; LEME, PATRICIA A. F.; MOREIRA, RENNAN G.; NOGUEIRA, MAURICIO L.; FERGUSON, NEIL M.; COSTA, SILVIA F.; PROENCA-MODENA, JOSE LUIZ; VASCONCELOS, ANA TEREZA R.; BHATT, SAMIR; LEMEY, PHILIPPE; WU, CHIEH-HSI; RAMBAUT, ANDREW; LOMAN, NICK J.; AGUIAR, RENATO S.; PYBUS, OLIVER G.; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO RODRIGUES; DISCOVERY, BRAZIL-UK CTR ARBOVIRUS. Evolution and epidemic spread of SARS-CoV-2 in Brazil. Science, v. 369, n. 6508, SI, p. 1255+, SEP 4 2020. Citações Web of Science: 116.
DE SOUZA, WILLIAM MARCIEL; BUSS, LEWIS FLETCHER; CANDIDO, DARLAN DA SILVA; CARRERA, JEAN-PAUL; LI, SABRINA; ZAREBSKI, ALEXANDER E.; PEREIRA, RAFAEL HENRIQUE MORAES; PRETE, JR., CARLOS A.; DE SOUZA-SANTOS, ANDREZA ARUSKA; PARAG, KRIS V.; BELOTTI, MARIA CAROLINA T. D.; VINCENTI-GONZALEZ, MARIA F.; MESSINA, JANEY; DA SILVA SALES, FLAVIA CRISTINA; ANDRADE, PAMELA DOS SANTOS; NASCIMENTO, VITOR HELOIZ; GHILARDI, FABIO; ABADE, LEANDRO; GUTIERREZ, BERNARDO; KRAEMER, MORITZ U. G.; BRAGA, CARLOS K. V.; AGUIAR, RENATO SANTANA; ALEXANDER, NEAL; MAYAUD, PHILIPPE; BRADY, OLIVER J.; MARCILIO, IZABEL; GOUVEIA, NELSON; LI, GUANGDI; TAMI, ADRIANA; DE OLIVEIRA, SILVANO BARBOSA; PORTO, VICTOR BERTOLLO GOMES; GANEM, FABIANA; DE ALMEIDA, WALQUIRIA APARECIDA FERREIRA; FANTINATO, FRANCIELI FONTANA SUTILE TARDETTI; MACARIO, EDUARDO MARQUES; DE OLIVEIRA, WANDERSON KLEBER; NOGUEIRA, MAURICIO L.; PYBUS, OLIVER G.; WU, CHIEH-HSI; CRODA, JULIO; SABINO, ESTER C.; FARIA, NUNO RODRIGUES. Epidemiological and clinical characteristics of the COVID-19 epidemic in Brazil. NATURE HUMAN BEHAVIOUR, v. 4, n. 8 JUL 2020. Citações Web of Science: 0.

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