Mapeamento de QTL de uma linhagem de Saccharomyces cerevisiae resistente a inibidores lignocelulósicos

• Processo: 19/22263-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de março de 2020
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Ana Paula Jacobus
• Beneficiário: Lucas Souza de Bem
• Instituição Sede: Instituto de Pesquisa em Bioenergia (IPBEN). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 17/24453-5 - Rede de colaboração: abordagens genéticas modernas para aumentar a tolerância de leveduras a hidrolisados lignocelulósicos enriquecidos, AP.BIOEN.JP
• Assunto(s): Repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas Genética molecular Proteína 9 associada à CRISPR Locos de características quantitativas Saccharomyces cerevisiae Alelos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cas9 | Crispr | Experimental Evolution | Molecular Genetics | Qtl | Saccharomyces cerevisiae | Second Generation Ethanol | Genética Molecular e Biotecnologia

Resumo

O mapeamento Quantitative Trait Loci (QTL) é uma excelente maneira de encontrar alelos adaptativos em linhagens de leveduras selvagens ou industriais que são naturalmente tolerantes aos hidrolisados lignocelulósicos (LCH). Nosso projeto propõe o uso de abordagens modernas de mapeamento de QTL, com base no sequenciamento de genoma inteiro (WGS) de segregantes agrupados, para desvendar a natureza poligênica subjacente à alta tolerância de LCH a uma linhagem de levedura selecionada. O mapeamento de QTLs auxiliado pelo sequenciamento de próxima geração (NGS) nunca foi aplicado para decifrar a base genética complexa da tolerância de leveduras a LCHs reais. Isso é muito importante, pois é sabido que existem efeitos sinérgicos entre os inibidores e que as respostas celulares globais são mais complexas que as dos inibidores individuais. Aqui neste projeto de Mestrado, o aluno estará envolvido na execução de protocolos de mapeamento de QTL com uma linhagem selecionada pelo professor Luiz Carlos Basso (ESALQ / USP). A linhagem selecionada apresenta tolerância formidável aos LCHs. Os segregantes de alta tolerância, resultantes do cruzamento da cepa tolerante com a referência de laboratório S288c, serão agrupados e direcionados ao WGS, permitindo o mapeamento e a identificação de candidatos a QTL que serão validados por técnicas de genética molecular de leveduras. (AU)