Caracterização do transcriptoma do músculo estriado esquelético de juvenis e adultos de pacu (Piaractus mesopotamicus)

• Processo: 19/23690-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de fevereiro de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2020
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Pesquisador responsável: Edson Assunção Mareco
• Beneficiário: Victor Hugo Garcia de Oliveira
• Instituição Sede: Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação. Universidade do Oeste Paulista (UNOESTE). Presidente Prudente , SP, Brasil
• Assunto(s): Biologia computacional Genômica funcional Desenvolvimento muscular Expressão gênica diferencial Organismos aquáticos Piaractus mesopotamicus Transcriptoma Análise de sequência de RNA Análise in silico
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Bioinformártica | Desenvolvimento muscular | expressão diferencial | RNA-seq | Genômica funcional de organismos aquáticos

Resumo

O pacu (Piaractus mesopotamicus) apresenta excelentes características zootécnicas, como rápido crescimento, parâmetro que influencia diretamente no aumento da musculatura estriada esquelética. Pesquisas envolvendo a caracterização de genes musculares têm sido realizadas com o uso de tecnologias moleculares, em espécies de peixes modelo como o Zebrafish que possuem o genoma sequenciado. No pacu, espécie que não possui o genoma sequenciado, esta falta de informação genética dificulta a realização de pesquisas relacionadas com a identificação das vias de sinalização que regulam o desenvolvimento, o crescimento e a manutenção do fenótipo muscular. A utilização de sequenciamento de próxima geração (Next-Generation Sequencing), tem se tornado muito efetivo e com progressivo aumento da cobertura, para a obtenção de sequências dos genes transcritos (transcriptoma) em espécies de peixes não modelo. Esta tecnologia possibilita gerar uma sequência referência do transcriptoma para o estudo da expressão gênica global, identificação de duplicações de genes (parálogos), além de permitir futuros sequenciamentos de transcriptomas e genomas da espécie e de outras filogeneticamente relacionadas. Neste trabalho, pretendemos avaliar in silico as diferenças entre a musculatura de adultos e juvenis de pacu. E em seguida realizar a validação de genes identificados como diferencialmente expressos nas análises de bioinformática.