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Aplicação de ferramentas genômicas para o estudo de bases de dados epidemiológicos

Processo: 19/27139-5
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado Direto
Vigência (Início): 01 de abril de 2020
Vigência (Término): 31 de março de 2024
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Imunologia - Imunogenética
Pesquisador responsável:Helder Takashi Imoto Nakaya
Beneficiário:Juan Carlo Santos e Silva
Instituição-sede: Centro de Inovação da USP (INOVA). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/14933-2 - Biologia integrativa aplicada à saúde humana, AP.JP2
Assunto(s):Biologia de sistemas   Aprendizado computacional   Genômica   Bases de dados científicos   Epidemiologia   Comorbidade

Resumo

Dados relacionados com a saúde humana, desde informações clínicas e epidemiológicas até imagens médicas e experimentos ômicos, estão sendo gerados e acumulados em uma quantidade sem precedentes na história. A análise e integração destas informações são fundamentais para melhorar nosso entendimento sobre a fisiopatologia das doenças, sua transmissão, assim como seu diagnóstico e tratamento. Este projeto propõe abordagens inovadoras para: analisar imensas bases de dados epidemiológicos; mapear hotspots de transmissão de doenças; integrar dados de transcritoma com dados clínicos e imunológicos; e usar aprendizado de máquina para interpretação e análise de imagens microscópicas. Técnicas atuais e modernas de análises de biologia de sistemas e aprendizado de máquina serão utilizadas e até mesmo desenvolvidas para cada abordagem, levando em conta os fundamentos da biologia integrativa. Espera-se que os resultados do projeto possam esclarecer diversos problemas relacionados à saúde humana, da análise automática de lâminas microscópicas até os mecanismos moleculares de doenças infecciosas e inflamatórias. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
SANTOS E SILVA, JUAN CARLO; VASCONCELOS, AMANDA PEREIRA; YONEHARA NOMA, ISABELLA HARUMI; NORONHA, NATALIA YUMI; AQUINO, RODRIGO; GIDDALURU, JEEVAN; DURAO, LUIZ; COSTA-MARTINS, ANDRE GUILHERME; SCHUCH, VIVIANE; MORAES-VIEIRA, PEDRO M.; NAKAYA, I, HELDER. Gene signatures of autopsy lungs from obese patients with COVID-19. CLINICAL NUTRITION ESPEN, v. 44, p. 475-478, AUG 2021. Citações Web of Science: 0.
SANTIAGO-CARVALHO, IGOR; DE ALMEIDA-SANTOS, GISLANE; BARBOSA BOMFIM, CAIO CESAR; DE SOUZA, PAULA CAROLINA; SANTOS E SILVA, JUAN CARLO; SILVA DE MELO, BRUNO MARCEL; AMARAL, EDUARDO PINHEIRO; PINHEIRO CIONE, MARCOS VINICIOS; LASUNSKAIA, ELENA; HIRATA, MARIO HIROYUKI; FARIAS ALVES-FILHO, JOSE CARLOS; NAKAYA, HELDER IMOTO; ALVAREZ, JOSE MARIA; D'IMPERIO LIMA, MARIA REGINA. P2x7 Receptor Signaling Blockade Reduces Lung Inflammation and Necrosis During Severe Experimental Tuberculosis. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 11, MAY 5 2021. Citações Web of Science: 0.

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