Explorando o papel das proteínas associadas à cromatina detectadas no Trypanosoma cruzi

• Processo: 20/02708-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Mestrado
• Data de Início da vigência: 01 de abril de 2020
• Data de Término da vigência: 30 de setembro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Julia Pinheiro Chagas da Cunha
• Beneficiário: Herbert Guimarães de Sousa Silva
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 18/15553-9 - Indo a fundo na regulação da cromatina de Trypanosoma cruzi: identificação de novas moléculas e questionando seu possível impacto no controle da transcrição, AP.JP2
• Assunto(s): Proteômica Cromatina Trypanosoma cruzi Região de controle de locus gênico CRISPR-Cas9 Imunoprecipitação da cromatina
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: cromatina | proteômica | Trypanosoma cruzi | Proteomica

Resumo

Para expandir o conhecimento sobre a regulação da cromatina do Trypanosoma cruzi, propusemos aproveitar metodologias de ponta que foram desenvolvidas para recuperar proteínas associadas à um determinado locus. Neste projeto de mestrado, exploraremos o papel de uma ou duas proteínas associadas à cromatina que serão detectadas através da metodologia mencionada acima. Idealmente, serão selecionadas as proteínas que foram encontradas de modo enriquecido em mais de um locus gênico. A função desses alvos serão exploradas através do sistema CRISPR/Cas9 para geração de parasitas Knouckouts (KO) e proteínas marcadas. Os parasitas KO serão avaliados da seguinte maneira: i. Quanto à capacidade de proliferação e diferenciação em tripomastigotas metacíclicos; e ii. Em relação a acessibilidade de interrupção gênica da cromatina e a taxa transcrição dos locus associados. Parasitas que expressam as proteínas marcadas serão utilizados para avaliarmos a localização celular dessas proteínas e identificarmos suas interações com outros componentes celulares utilizando a técnica de imunoprecipitação (IP). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

JERONIMO LIMA, ALEX RANIERI; DE SOUSA SILVA, HERBERT GUIMARAES; POUBEL, SALOE; ROSON, JULIANA NUNES; OLIVEIRA DE LIMA, LOYZE PAOLA; COSTA-SILVA, HELLIDA MARINA; GONCALVES, CAMILA SILVA; GALANTE, PEDRO A. F.; HOLETZ, FABIOLA; MOTTA, MARIA CRISTINA MACHADO M.; et al. Open chromatin analysis in Trypanosoma cruzi life forms highlights critical differences in genomic compartments and developmental regulation at tDNA loci. EPIGENETICS & CHROMATIN, v. 15, n. 1, p. 16-pg., 2022-06-01. (13/07467-1, 18/15553-9, 20/02708-4, 18/14432-3, 19/19834-5, 19/19690-3)