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Implementação do serviço de proteômica baseada em espectrometria de massas no FoRC

Processo: 19/27707-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de junho de 2020
Vigência (Término): 31 de maio de 2022
Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Ciência e Tecnologia de Alimentos - Ciência de Alimentos
Pesquisador responsável:Bernadette Dora Gombossy de Melo Franco
Beneficiário:Vanessa Sofia Mendes Geraldes
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/07914-8 - FoRC - Centro de Pesquisa em Alimentos, AP.CEPID
Assunto(s):Processamento de dados   Proteômica   Mineração de dados

Resumo

Este plano de trabalho resume-se na viabilização do processamento de dados brutos oriundos das análises dos serviços relacionados a técnica de proteômica e metabolômica por meio de cromatografia líquida e espectrometria de massas, inicialmente aos pesquisadores que fazem parte do FoRC e posteriormente aos demais pesquisadores internos e externos à comunidade USP. O planejamento adequado antes do início dos experimentos por espectrometria de massas em estudos de metabolômica e proteômica é fundamental para evitar equívocos durante as comparações. No pós-análises, da mesma forma, o alinhamento e processamento dos resultados antes das comparações também é etapa crucial no processo e interpretação final dos experimentos. Para isso, se faz necessária a utilização de ferramentas estatísticas e de tratamento das informações geradas pelos equipamentos por meio de softwares adquiridos junto aos equipamentos, bem como os disponíveis em opensource, e workflow adequados onde o papel de um analista especialista em tecnologia de informação, principalmente em cromatografia e espectrometria de massas, é de suma importância. Além dos processos mencionados pré e pós-análises, também utilizaremos os resultados para posterior integração com os dados gerados em outras plataformas como genômica e transcriptômica.