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Integrando abordagens proteogenômicas e de biologia de sistemas para investigar os papéis da melanopsina e canais TRP na ritmicidade circadiana

Processo: 20/04524-8
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de abril de 2020
Vigência (Término): 30 de setembro de 2024
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Fisiologia - Fisiologia de Órgãos e Sistemas
Pesquisador responsável:Ana Maria de Lauro Castrucci
Beneficiário:José Thalles Jocelino Gomes de Lacerda
Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:17/24615-5 - Derrubando um paradigma? Melanopsina, um fotopigmento canônico, atuando como sensor para ajuste do relógio em órgãos não expostos à luz, e sua possível interação com canais TRP: estudo transdisciplinar envolvendo aspectos fisiológicos e patológicos, AP.TEM
Bolsa(s) vinculada(s):22/16606-4 - Tecnologias avançadas de espectrometria de massa direcionada para a descoberta de isoformas de proteínas que são impulsionadoras da doença arterial coronariana (DAC), BE.EP.PD
Assunto(s):Proteogenômica   Ritmo circadiano   Biologia computacional   Melanopsinas   Tecido adiposo marrom   Tecido adiposo branco   Estresse fisiológico   Processamento de proteína pós-traducional   Interação proteína-proteína
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Biologia de redes e sistemas | Estresse Metabólico | Modificações pós-traducionais | Proteogenômica | ritmo circadiano | tecidos periféricos | Proteômica e bioinformática

Resumo

Com base no objetivo do referido projeto temático, a proposta de pesquisa tem como principal abordagem a análise proteômica por LC-ESI-MS/MS, para realizar uma avaliação comparativa (qualitativa e quantitativa) de coração, tecidos adiposos marrom e branco dos modelos animais WT e KO e, assim, obter uma maior compreensão sobre os papeis dos genes Opn4, TrpV1, TrpM8, TrpA1 e AdrB1 e suas associações, na fisiologia do ritmo circadiano sob condições de estresse metabólico (Obesidade e Caquexia) e desafio de baixa temperatura. Embora a análise transcriptômica, já realizada pelo grupo de pesquisa, possa fornecer informações valiosas sobre esse cenário, alguns estudos têm relatado diferenças entre dados de transcriptoma e proteoma devido a regulações pós-transcricionais e modificações pós-transducionais (Post-Translational Modifications, PTMs). Análises proteômicas tem demonstrado que algumas PTMs podem regular fatores de transcrição e, consequentemente, modular o transcriptoma. Além disso, as PTMs (ex: fosforilação, ubiquitinação, glicosilação, biotinilação, acetilação) fazem parte do mecanismo pelo qual o relógio circadiano controla o metabolismo. A partir destas informações, os objetivos da proposta são: (1) realizar análise proteômica comparativa dos tecidos de animais WT e KO para os genes citados e também das linhagens celulares. A análise será qualitativa e quantitativa (Label-free quantification ou TMT-MS); (2) usar os dados do transcriptoma como banco de dados para análise proteômica - abordagem proteogenômica; (3) comparar os dados quantitativos da análise transcriptômica e proteômica; (4) a partir dos dados obtidos pelas "ômicas", realizar análise de enriquecimento funcional e criar redes de interação proteína-proteína para compreender as alterações das vias metabólicas e dos processos biológicos; (5) realizar uma análise comparativa de PTMs. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
LACERDA, JOSE THALLES; GOMES, PATRICIA R. L.; ZANETTI, GIOVANNA; MEZZALIRA, NATHANA; LIMA, OTONIEL G.; DE ASSIS, LEONARDO V. M.; GULER, ALI; CASTRUCCI, ANA MARIA; MORAES, MARIA NATHALIA. Lack of TRPV1 Channel Modulates Mouse Gene Expression and Liver Proteome with Glucose Metabolism Changes. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 23, n. 13, p. 24-pg., . (17/24615-5, 21/01659-2, 14/16412-9, 20/04524-8, 18/23915-8, 18/16511-8, 13/02131-5, 12/50214-4, 18/14728-0, 17/26651-9, 21/09923-0)
MONTEIRO DE ASSIS, LEONARDO VINICIUS; LACERDA, JOSE THALLES; MORAES, MARIA NATHALIA; DOMINGUEZ-AMOROCHO, OMAR ALBERTO; KINKER, GABRIELA SARTI; MENDES, DAVI; SILVA, MATHEUS MOLINA; MARTINS MENCK, CARLOS FREDERICO; SARAIVA CAMARA, NIELS OLSEN; DE LAURO CASTRUCCI, ANA MARIA. Melanopsin (Opn4) is an oncogene in cutaneous melanoma. COMMUNICATIONS BIOLOGY, v. 5, n. 1, p. 15-pg., . (19/19435-3, 19/25129-2, 17/24217-0, 17/26651-9, 18/16511-8, 12/50214-4, 18/14728-0, 17/24615-5, 17/18781-0, 20/04524-8, 13/24337-4, 17/16711-4)
SUA-CESPEDES, CRISTHIAN; LACERDA, JOSE THALLES; ZANETTI, GIOVANNA; DAVID, DANIELA DANTAS; MORAES, MARIA NATHALIA; DE ASSIS, LEONARDO V. M.; CASTRUCCI, ANA MARIA L.. Melanopsin (OPN4) is a novel player in skin homeostasis and attenuates UVA-induced effects. JOURNAL OF PHOTOCHEMISTRY AND PHOTOBIOLOGY B-BIOLOGY, v. 242, p. 15-pg., . (16/00696-3, 13/07937-8, 19/19005-9, 21/01659-2, 17/26651-9, 18/23043-0, 18/16511-8, 12/50214-4, 12/12663-1, 18/14728-0, 17/24615-5, 20/04524-8, 14/16412-9)

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