Proteômica estrutural: desenho, síntese e aplicação de agentes de ligação cruzada de nova geração

• Processo: 20/00144-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2020
• Data de Término da vigência: 30 de junho de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
• Pesquisador responsável: Fabio Cesar Gozzo
• Beneficiário: Rafael Douglas Clemente Gallo
• Instituição Sede: Instituto de Química (IQ). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/17264-3 - Novas fronteiras em proteômica estrutural: caracterizando estruturas de proteínas e complexos proteicos por espectrometria de massas, AP.TEM
• Assunto(s): Espectrometria de massas Proteômica Elementos estruturais de proteínas
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Espectrometria de massas | estrutura de proteínas | proteômica | Espectrometria de massas

Resumo

A determinação da estrutura de proteínas e suas interações com outras proteínas são informações chaves na elucidação do mecanismo de ação dessas macromoléculas. A ligação cruzada associada à Espectrometria de Massas (EM) é uma técnica que permite a caracterização estrutural de proteínas e complexos proteicos, especialmente nos casos em que as técnicas de alta resolução não podem ser empregadas. Por ser baseada em EM, essa técnica é universal, podendo ser aplicada a uma grande variedade de proteínas. Além disso, a técnica se beneficia de todas as vantagens da EM, como alta sensibilidade, rapidez de análise e facilidade de uso. Embora a estrutura de vários complexos proteína-proteína já tenham sido resolvidas com sucesso, há ainda limitações a serem superadas para que a estratégia de ligação-cruzada/EM seja ainda mais abrangente. Entre os maiores desafios destacam-se a dificuldade em detectar e identificar as espécies modificadas pelos agentes de ligações cruzadas (ALCs), resultando em um número limitado de informações estruturais a respeito do sistema de interesse. O presente projeto visa o desenvolvimento de novos ALCs visando resolver os problemas mencionados acima, permitindo o enriquecimento das espécies modificadas e superando a dificuldade de detecção. Objetiva-se que esses ALCs facilitem a identificação dessas espécies através do uso de marcadores de defeito de massa, que permitem uma distinção mais clara entre espécies modificadas e não modificadas. As novas famílias de ALCs propostas aqui tem o potencial de gerar um grande avanço na qualidade dos dados obtidos e aumentar significativamente a aplicabilidade desta técnica. (AU)

Publicações científicas

(5)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MUNARETTO, LAIELI S.; GALLO, RAFAEL D. C.; LEAO, LUIZ PAULO M. O.; JURBERG, IGOR D.. H-F bond insertions into alpha-diazo carbonyl compounds. ORGANIC & BIOMOLECULAR CHEMISTRY, v. 20, n. 31, p. 5-pg., 2022-03-24. (20/00144-6, 19/01235-8)

MUNARETTO, LAIELI S.; DOS SANTOS, CAIO Y.; GALLO, RAFAEL D. C.; OKADA JR, CELSO Y.; DEFLON, VICTOR M.; JURBERG, IGOR D.. Visible-Light-Mediated Strategies to Assemble Alkyl 2-Carboxylate-2,3,3-Trisubstituted beta-Lactams and 5-Alkoxy-2,2,4-Trisubstituted Furan-3(2H)-ones Using Aryldiazoacetates and Aryldiazoketones. ORGANIC LETTERS, v. 23, n. 23, p. 9292-9296, DEC 3 2021. (19/01235-8, 20/00144-6)

GALLO, RAFAEL D. C.; DUARTE, MARCELO; DA SILVA, AMANDA F.; OKADA, JR., CELSO Y.; DEFLON, VICTOR M.; JURBERG, IGOR D.. Selective C-C Bond Cleavage Strategy Promoted by Visible Ligh. ORGANIC LETTERS, v. 23, n. 22, p. 8916-8920, NOV 19 2021. (20/00144-6, 19/01235-8)

STIVANIN, MATEUS L.; GALLO, RAFAEL D. C.; SPADETO, JOAO PAULO M.; CORMANICH, RODRIGO A.; JURBERG, IGOR D.. visible light-mediated three-component strategy based on the ring-opening of cyclic ethers with aryldiazoacetates and nucleophile. ORGANIC CHEMISTRY FRONTIERS, v. 9, n. 5, p. 1321-1326, MAR 1 2022. (20/00144-6, 20/06536-3, 18/03910-1, 19/01235-8)

GALLO, RAFAEL D. C.; CARIELLO, GUILHERME; GOULART, TALES A. C.; JURBERG, IGOR D.. Visible light-mediated photolysis of organic molecules: the case study of diazo compounds. CHEMICAL COMMUNICATIONS, v. 59, n. 48, p. 15-pg., 2023-05-11. (22/01104-3, 20/00144-6, 22/01750-2, 19/17721-9)