Simulação computacional da interação entre o antibiótico linezolida e o sítio ativo da subunidade ribossômica 50s da bactéria Haloarcula marismortui

• Processo: 20/05535-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Data de Início da vigência: 01 de julho de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de dezembro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
• Pesquisador responsável: Aguinaldo Robinson de Souza
• Beneficiário: Giulia Saneti Grandini
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Assunto(s): Tuberculose Oxazolidinonas Linezolida Antibióticos Haloarcula marismortui Teoria do funcional da densidade Simulação por computador Análise espectroscópica Difração por raios X
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: antibiotico | Haloarcula marismortui | linezolida | ribossomo 50S | teoria do funcional da densidade | Tuberculose | Simulação computacional

Resumo

A linezolida foi o primeiro antibiótico da classe das Oxazolidinonas a ser sintetizado para fins farmacêuticos. Sendo inibidor da síntese proteica bacteriana, a molécula tornou-se muito favorável no combate a doenças causadas por bactérias multirresistentes a drogas gram-positivas. As propriedades biológicas e os estudos teóricos e experimentais têm esclarecido, nos últimos anos, a sua ação terapêutica. No presente projeto de pesquisa iremos estudar do ponto de vista da simulação computacional as interações e possíveis conformações adotadas pela linezolida na sua forma isolada e quando complexada no sítio de interação da subunidade ribossômica 50S. A partir das conformações obtidas no estado isolado e na presença de solventes (implícito e explícito) iremos comparar com aquela obtida pela técnica de difração de raios-x. Serão objeto de estudo, também, as propriedades espectroscópicas da linezolida como a absorção de luz circularmente polarizada e na região do ultravioleta. O projeto de pesquisa tem como objetivo principal fornecer subsídios para o entendimento das principais interações e conformações adotadas pela linezolida quando da formação do complexo com a unidade 50S e suas bases purínicas e pirimidínicas presentes no sítio de interação.

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE SOUZA, CARMEN REGINA; YOGUIM, MAURICIO IKEDA; PAVAN, NATHALIA MARIANA; MORGON, NELSON HENRIQUE; XIMENES, VALDECIR FARIAS; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON. Evidence of the Differences Between Human and Bovine Serum Albumin Through the Interaction with Coumarin-343: Experimental (ICD) and Theoretical Studies (DFT and Molecular Docking). BIOPHYSICA, v. 5, n. 3, p. 16-pg., 2025-07-15. (13/08293-7, 19/12294-5, 19/18445-5, 24/00959-0, 18/12950-7, 20/05535-3, 15/22338-9)

GRANDINI, GIULIA SANETI; MORGON, NELSON HENRIQUE; DE SOUZA, AGUINALDO ROBINSON. Theoretical study of the interaction between the antibiotic linezolid and the active site of the 50S ribosomal subunit of the bacterium Haloarcula marismortui. CHIRALITY, v. N/A, p. 7-pg., 2023-11-14. (20/05535-3)