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Simulação computacional da interação entre o antibiótico linezolida e o sítio ativo da subunidade ribossômica 50s da bactéria Haloarcula marismortui

Processo: 20/05535-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de julho de 2020
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Pesquisador responsável:Aguinaldo Robinson de Souza
Beneficiário:Giulia Saneti Grandini
Instituição-sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
Assunto(s):Tuberculose   Oxazolidinonas   Linezolida   Antibióticos   Haloarcula marismortui   Teoria do funcional da densidade   Simulação por computador   Análise espectroscópica   Difração por raios X

Resumo

A linezolida foi o primeiro antibiótico da classe das Oxazolidinonas a ser sintetizado para fins farmacêuticos. Sendo inibidor da síntese proteica bacteriana, a molécula tornou-se muito favorável no combate a doenças causadas por bactérias multirresistentes a drogas gram-positivas. As propriedades biológicas e os estudos teóricos e experimentais têm esclarecido, nos últimos anos, a sua ação terapêutica. No presente projeto de pesquisa iremos estudar do ponto de vista da simulação computacional as interações e possíveis conformações adotadas pela linezolida na sua forma isolada e quando complexada no sítio de interação da subunidade ribossômica 50S. A partir das conformações obtidas no estado isolado e na presença de solventes (implícito e explícito) iremos comparar com aquela obtida pela técnica de difração de raios-x. Serão objeto de estudo, também, as propriedades espectroscópicas da linezolida como a absorção de luz circularmente polarizada e na região do ultravioleta. O projeto de pesquisa tem como objetivo principal fornecer subsídios para o entendimento das principais interações e conformações adotadas pela linezolida quando da formação do complexo com a unidade 50S e suas bases purínicas e pirimidínicas presentes no sítio de interação.

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