Os processos evolutivos nas duplicações gênicas de RAD51 em amebas

• Processo: 20/00364-6
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
• Vigência (Início): 01 de setembro de 2020
• Vigência (Término): 31 de julho de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Zoologia
• Pesquisador responsável: Daniel José Galafasse Lahr
• Beneficiário: João Pedro Alcino Barbosa
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Assunto(s): Filogenia Duplicação gênica Recombinases Transcriptoma Amoeba Reparo do DNA Extração de DNA Reação em cadeia da polimerase em tempo real
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: análise filogenética | Arcellinida | evolução de famílias gênicas | Recombinase | Evolução de Microrganismos Eucariontes

Resumo

Em um projeto-piloto encontramos evidência de duplicação gênica da recombinase RAD51 no transcriptoma da ameba tecada Cryptodifflugia operculata.RAD51 faz parte da superfamília das recombinases. Recombinases são proteínas responsáveis pelo reparo de DNA por homologia. Este projeto visa definir a presença ou ausência de duplicações de RAD51 no genoma de Cryptodifflugia operculata a partir de extração de DNA, clonagem e análise por PCR. Caso as cópias não sejam artefatuais, serão analisadas suas taxas de substituições sinônimas e não sinônimas. Os valores obtidos serão comparados entre si buscando determinar o processo de seleção a que estão submetidas (adaptativa, purificadora ou neutra). (AU)