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Análise dos satelitomas de diferentes populações de Astyanax lacustris

Processo: 19/24914-8
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de julho de 2020
Vigência (Término): 30 de junho de 2021
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
Pesquisador responsável:Fábio Porto-Foresti
Beneficiário:Rodrigo Milan Calegari
Instituição-sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional   DNA   Genomas   Astyanax   Satélites   Sequências repetitivas dispersas   Análise de sequência de DNA

Resumo

O estudo de sequências repetitivas foi bastante impactado pela popularização do sequenciamento de nova geração, juntamente com o desenvolvimento de novos scripts e softwares. Dentre estes, as coleções bioinformáticas como Reapeat Explorer e sat Miner têm reduzido o custo e o tempo das análises, permitindo um maior rendimento das análises. Os DNAs satélites (satDNAs) são sequências repetitivas in também e o catálogo completo deste tipo de sequência em uma determinada espécie é chamado de satelitoma. Em geral, os satDNAs não codificam algum produto funcional, sendo muitas vezes a sua função totalmente desconhecida no genoma. Nesse sentido, estas sequências estão sujeitas a uma rápida evolução, tornando os satelitomas de espécies próximas, bastante divergente. Nesse contexto, este estudo tem como objetivo caracterizar e comparar os satelitomas de diferentes populações de Astyanax lacustris, utilizando de ferramentas desenvolvidas com auxílio da bioinformática, com o intuito de melhor compreender os processos evolutivos pelos quais estão sujeitos às sequências repetitivas de DNA satélite no genoma de uma mesma espécie, encontradas em diferentes bacias.