Análise sistêmica e integrativa dos mecanismos moleculares associados à imunorregulação em pacientes com COVID-19

• Processo: 20/09146-1
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Vigência (Início): 01 de agosto de 2020
• Vigência (Término): 31 de outubro de 2022
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina
• Pesquisador responsável: Otávio Cabral Marques
• Beneficiário: Paula Paccielli Freire-Barguil
• Instituição Sede: Instituto de Ciências Biomédicas (ICB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 20/07069-0 - Análise sistêmica e integrativa dos mecanismos de exaustão dos linfócitos T de pacientes com COVID-19, AP.R
• Assunto(s): Imunologia COVID-19 SARS-CoV-2 Infecções por Coronavirus Citocinas Mecanismos das infecções Imunorregulação Imunogenética Transcriptoma Pandemias
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Covid-19 | Imunogenética | Imunologia sistêmica e integrativa | imunorregulação | SARS-CoV-2 | Imunologia

Resumo

A atual pandemia da nova doença respiratória Coronavírus 2019 (COVID-19) configura um estado de emergência pública internacional. O vírus causador da doença é denominado síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2) e tem circulado por todo o mundo, desencadeando manifestações clínicas que variam de casos assintomáticos à síndrome respiratória aguda grave e à morte, principalmente nos indivíduos portadores de comorbidades (ex: hipertensão, diabetes e asma). Sugere-se, desse modo, a influência de fatores imunológicos e de outros fatores intrínsecos do hospedeiro no controle do desenvolvimento da doença. Pacientes que desenvolvem o quadro grave da doença podem ir a óbito devido à intensa imunodesregulação e uma alta liberação citocinas. Contudo, o conhecimento a respeito dos mecanismos imunológicos sistêmicos que controlam a proteção contra o SARS-CoV-2 ainda é escasso e os mecanismos moleculares associados à imunorregulação ainda permanece por ser caracterizada. A hipótese desse projeto é que os genes associados à imunorregulação de pacientes com COVID-19 tenham um perfil molecular sistêmico específico. Assim, este projeto objetiva caracterizar os mecanismos moleculares associados à imunorregulação em pacientes infectados por SARS-Cov-2, com COVID-19 leve e grave. Realizaremos uma abordagem sistêmica e integrativa, investigando o transcriptoma de células imunes, seguido por ensaios funcionais específicos de validação da triagem de alto rendimento (análise do transcriptoma). Além disso, realizaremos uma metanálise de dados previamente depositados no ArrayExpress e GEO (do inglês, Gene Expression Omnibus) para determinar as redes de co-expressão gênica que regulam sistemicamente a resposta imune ao SARS-CoV-2. Essa abordagem experimental em larga nos permitirá definir as assinaturas imunológicas, vias de sinalização e redes de co-expressão gênica e das interações moleculares (interactoma) e metabólicas (metaboloma) envolvidos na resposta imune contra SARS-CoV-2. Deste modo, promoverá um estudo translacional e multidisciplinar que poderá identificar biomarcadores para o diagnóstico diferencial. Esse fato abrirá caminhos para o desenvolvimento de novas terapias específicas que reduzam a mortalidade e a morbidade induzida pelo vírus. (AU)

Publicações científicas

(6)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; TORRENTES DE CARVALHO, AMANDA; CUNHA, DANIELA PRADO; MATHIAS DA FONSECA, DENNYSON LEANDRO; EL KHAWANKY, NADIA; FREIRE, PAULA PACCIELLI; CABRAL-MIRANDA, GUSTAVO; SCHIMKE, LENA F.; CAMARA, NIELS OLSEN SARAIVA; OCHS, HANS D.; et al. The clinical spectrum and immunopathological mechanisms underlying ZIKV-induced neurological manifestations. PLoS Neglected Tropical Diseases, v. 15, n. 8, AUG 2021. (18/18886-9, 20/09146-1, 17/05264-7, 20/01688-0)

FREIRE, PAULA P.; MARQUES, ALEXANDRE H. C.; BAIOCCHI, GABRIELA C.; SCHIMKE, LENA F.; FONSECA, DENNYSON L. M.; SALGADO, RANIERI C.; FILGUEIRAS, IGOR S.; NAPOLEAO, SARAH M. S.; PLACA, DESIREE R.; AKASHI, KAREN T.; et al. The relationship between cytokine and neutrophil gene network distinguishes SARS-CoV-2-infected patients by sex and age. JCI INSIGHT, v. 6, n. 10, MAY 24 2021. (20/09146-1, 20/01688-0, 17/05264-7, 13/50343-1, 20/07069-0, 20/07972-1)

CABRAL-MARQUES, OTAVIO; HALPERT, GILAD; SCHIMKE, LENA F.; OSTRINSKI, YURI; VOJDANI, ARISTO; BAIOCCHI, GABRIELA CRISPIM; FREIRE, PAULA PACCIELLI; FILGUEIRAS, IGOR SALERNO; ZYSKIND, ISRAEL; LATTIN, MIRIAM T.; et al. Autoantibodies targeting GPCRs and RAS-related molecules associate with COVID-19 severity. NATURE COMMUNICATIONS, v. 13, n. 1, p. 12-pg., 2022-03-09. (20/07069-0, 18/18886-9, 20/16246-2, 20/11710-2, 20/07972-1, 20/09146-1, 20/01688-0)

CURY, S. S.; OLIVEIRA, J. S.; BIAGI-JUNIOR, C. A. O.; SILVA JR, W. A.; REIS, P. P.; CABRAL-MARQUES, O.; HASIMOTO, E. N.; FREIRE, P. P.; CARVALHO, R. F.. Transcriptional profiles and common genes link lung cancer with the development and severity of COVID-19. Gene, v. 852, p. 11-pg., 2023-02-05. (13/50343-1, 20/09146-1)

GONCALVES, RENATA DE CASTRO; FREIRE, PAULA PACCIELLI; COLETTI, DARIO; SEELAENDER, MARILIA. Tumor Microenvironment Autophagic Processes and Cachexia: The Missing Link?. FRONTIERS IN ONCOLOGY, v. 10, FEB 2 2021. (20/09146-1, 12/50079-0, 20/07765-6)

BORGES, LYSANDRO P.; GUIMARAES, ADRIANA G.; FONSECA, DENNYSON LEANDRO M.; FREIRE, PAULA P.; BARRETO, IKARO D. C.; SOUZA, DANIELA R., V; GURGEL, RICARDO Q.; LOPES, ALINE S. A.; DE REZENDE NETO, JOSE MELQUIADES; DOS SANTOS, KEZIA A.; et al. Cross-sectional analysis of students and school workers reveals a high number of asymptomatic SARS-CoV-2 infections during school reopening in Brazilian cities. HELIYON, v. 8, n. 11, p. 11-pg., 2022-11-07. (20/01688-0, 18/18886-9, 20/09146-1, 20/07069-0)