Busca avançada
Ano de início
Entree

Mapeamento de assinaturas epigenômicas de células tronco de gliomas

Processo: 20/09046-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de agosto de 2020
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2020
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
Pesquisador responsável:Tathiane Maistro Malta Pereira
Beneficiário:Maycon Marção
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/00583-0 - Análise epigenômica integrativa de gliomas: definindo regiões regulatórias associadas ao stemness e ao fenótipo hipermetilador de tumores com mutações nos genes IDH1/2, AP.JP
Assunto(s):Biologia computacional   Aprendizado computacional   Células-tronco neurais   Epigenômica   Glioma   Metilação de DNA   Mapeamento

Resumo

Este pesquisador trabalhará na identificação de assinaturas de células-tronco neurais em amostras de glioma. Para isso serão utilizados dados públicos e ferramentas R/biocondutor de código aberto para mapear assinaturas de células-tronco neurais não tumoraisque podem ser usadas para medir o estado de desdiferenciação (ou Stemness) de amostras deglioma em relação à sua célula de origem. Será definida uma assinatura de metilação de DNA de células-tronco neurais e utilizando esta assinatura será construído um modelo de predição de Stemness usando dados de metilação de DNA. Em seguida o modelo de predição será aplicado em amostras de glioma do banco de dado público Atlas do Genoma do Câncer (TCGA) para a quantificação do Stemness nos tumores. A identificação de amostras de glioma com assinaturas de células-tronco contribuirá para o entendimento da gliomagênese e célula de origem.