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Desenvolvimento de banco de dados de variantes genéticas DesBraVar (Depósito de Sequencias Brasileiras e Variantes)

Processo: 19/21290-3
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de outubro de 2020
Vigência (Término): 30 de setembro de 2021
Área do conhecimento:Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
Pesquisador responsável:Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
Beneficiário:Diego Lima de Carvalho
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco, AP.CEPID
Assunto(s):Genômica   Variação genética   Desenvolvimento de software   Banco de dados   Processamento de dados

Resumo

Desenvolver uma aplicação que servirá tanto como repositório para armazenamento de dados genômicos, quanto para software com web interface para análise de variantes genéticas (via client-side) e processamento de dados de sequenciamento de exoma e genoma de várias centenas de indivíduos (via server-side). Configuração dos servidores de processamento, armazenamento e web server; respectiva manutenção nos mesmos. Integração da aplicação DesBraVar (banco de dados genômico) com o sistema de prontuário eletrônico (banco de dados fenotípico) do CEGH-CEL. Reestruturação do banco de dados do sistema de prontuário eletrônico e eventuais manutenções na aplicação. Eventuais atividades de manutenção, suporte técnico e desenvolvimento de sites e ferramentas vinculadas ao CEGH-CEL.