Desenvolvimento de banco de dados de variantes genéticas DesBraVar (Depósito de Sequencias Brasileiras e Variantes)

• Processo: 19/21290-3
• Linha de fomento: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Vigência (Início): 01 de outubro de 2020
• Vigência (Término): 30 de setembro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências Exatas e da Terra - Ciência da Computação - Sistemas de Computação
• Pesquisador responsável: Maria Rita dos Santos e Passos Bueno
• Beneficiário: Diego Lima de Carvalho
• Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/08028-1 - CEGH-CEL - Centro de Estudos do Genoma Humano e de Células-Tronco, AP.CEPID
• Assunto(s): Genômica Variação genética Desenvolvimento de software Banco de dados Processamento de dados

Resumo

Desenvolver uma aplicação que servirá tanto como repositório para armazenamento de dados genômicos, quanto para software com web interface para análise de variantes genéticas (via client-side) e processamento de dados de sequenciamento de exoma e genoma de várias centenas de indivíduos (via server-side). Configuração dos servidores de processamento, armazenamento e web server; respectiva manutenção nos mesmos. Integração da aplicação DesBraVar (banco de dados genômico) com o sistema de prontuário eletrônico (banco de dados fenotípico) do CEGH-CEL. Reestruturação do banco de dados do sistema de prontuário eletrônico e eventuais manutenções na aplicação. Eventuais atividades de manutenção, suporte técnico e desenvolvimento de sites e ferramentas vinculadas ao CEGH-CEL.