Bolsa 20/12017-9 - Biologia de sistemas, Trypanosoma - BV FAPESP
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Aprendizado de máquina para interpretação de análise de imagens microscópicas

Processo: 20/12017-9
Modalidade de apoio:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2020
Data de Término da vigência: 31 de janeiro de 2024
Área de conhecimento:Interdisciplinar
Pesquisador responsável:Helder Takashi Imoto Nakaya
Beneficiário:Mauro César Cafundó de Morais
Instituição Sede: Instituto Israelita de Ensino e Pesquisa Albert Einstein (IIEPAE). Sociedade Beneficente Israelita Brasileira Albert Einstein (SBIBAE). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:18/14933-2 - Biologia integrativa aplicada à saúde humana, AP.JP2
Assunto(s):Biologia de sistemas   Trypanosoma   Plasmodium   Leishmania   Aprendizado computacional   Processamento de imagens   Microscopia
Palavra(s)-Chave do Pesquisador:Aprendizado de Máquina | Processamento de imagens | Biologia de Sistemas

Resumo

O presente plano de trabalho tem por objetivo extrair características fenotípicas das espécies de parasitas Trypanosoma, Plasmodium e Leishmania em imagens derivadas de microscopia. Tais características consistem em atributos de curvatura (mínimo, máximo, média, desvio padrão, variância, entropia e energia potencial); geométricos (área, circularidade, proporção, perímetro, distâncias máximas e mínimas); e estatísticas de textura (contraste, momento, segundo momento angular, homogeneidade, entropia e correlação). Esses atributos serão então selecionados através de análise de componente principal (PCA). Posteriormente, os atributos melhor classificados desta forma serão usados em algoritmo de classificação de abordagem geométrica - Support Vector Machine (SVM). Tal método apresenta a vantagem de ser mais barato computacionalmente, pois não necessita de unidade de processamento gráfico (GPU). Dessa forma poderemos estabelecer uma nova abordagem de diagnóstico mais rápido e preciso para as doenças causadas por esses parasitas. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
CAFUNDO MORAIS, MAURO CESAR; SILVA, DIOGO; MILAGRE, MATHEUS MARQUES; DE OLIVEIRA, MAYKON TAVARES; PEREIRA, THAIS; SILVA, JOAO SANTANA; COSTA, LUCIANO DA F.; MINOPRIO, PAOLA; CESAR JUNIOR, ROBERTO MARCONDES; GAZZINELLI, RICARDO; et al. Automatic detection of the parasite Trypanosoma cruzi in blood smears using a machine learning approach applied to mobile phone images. PeerJ, v. 10, p. 19-pg., . (20/12017-9, 18/14933-2)