Elaboração de bibliotecas para o sequenciamento de alto rendimento e análises primárias de dados

• Processo: 20/13339-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Vigência (Início): 01 de novembro de 2020
• Vigência (Término): 16 de fevereiro de 2021
• Área do conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
• Pesquisador responsável: Mario Hiroyuki Hirata
• Beneficiário: Beatriz Fernandes
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 16/12899-6 - Caracterização genômica, epigenômica e farmacogenômica de portadores de hipercolesterolemia familial na população brasileira, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia molecular Biblioteca gênica Sequenciamento de nova geração Fragmentação do DNA Análise de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Molecular - Sequenciamento - DNA - RNA - Análises - | NGS - Fragmentação - Replicação | Biologia Molecular

Resumo

As novas tecnologias de sequenciamento, denominadas de tecnologias de sequenciamentos de alto rendimento ou de próxima geração (Next Generation Sequencing-NGS), sequenciam o DNA em plataformas capazes de gerar informação sobre milhões de pares de bases em uma única corrida, sendo uma alternativa poderosa para estudos de genômica estrutural e funcional (Carvalho & Silva, 2010; Mardis, 2013). O ponto de partida comum é a preparação das amostras para o sequenciamento que consiste na fragmentação aleatória do DNA e a adição de adaptadores específicos de cada plataforma (Parkinson et al., 2012). A integridade do DNA que será utilizado é de fundamental importância para garantir que a fragmentação seja adequada, já que o tamanho dos fragmentos é um parâmetro chave para a construção da biblioteca (Head et al., 2014). O principal objetivo quando se prepara uma biblioteca é obter, mesmo com a complexidade, o mínimo de viés possível, eliminando os fatores externos da manipulação do processo. Assim, espera-se realizar um preparo de biblioteca adequado visando obter os melhores resultados para diminuição do viés na análise de dados que será posteriormente realizada. (AU)