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Elaboração de bibliotecas para o sequenciamento de alto rendimento e análises primárias de dados

Processo: 20/13339-0
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
Vigência (Início): 01 de novembro de 2020
Vigência (Término): 16 de fevereiro de 2021
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Farmácia
Pesquisador responsável:Mario Hiroyuki Hirata
Beneficiário:Beatriz Fernandes
Instituição-sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/12899-6 - Caracterização genômica, epigenômica e farmacogenômica de portadores de hipercolesterolemia familial na população brasileira, AP.TEM
Assunto(s):Biologia molecular   Biblioteca gênica   Sequenciamento de nova geração   Fragmentação do DNA   Análise de dados

Resumo

As novas tecnologias de sequenciamento, denominadas de tecnologias de sequenciamentos de alto rendimento ou de próxima geração (Next Generation Sequencing-NGS), sequenciam o DNA em plataformas capazes de gerar informação sobre milhões de pares de bases em uma única corrida, sendo uma alternativa poderosa para estudos de genômica estrutural e funcional (Carvalho & Silva, 2010; Mardis, 2013). O ponto de partida comum é a preparação das amostras para o sequenciamento que consiste na fragmentação aleatória do DNA e a adição de adaptadores específicos de cada plataforma (Parkinson et al., 2012). A integridade do DNA que será utilizado é de fundamental importância para garantir que a fragmentação seja adequada, já que o tamanho dos fragmentos é um parâmetro chave para a construção da biblioteca (Head et al., 2014). O principal objetivo quando se prepara uma biblioteca é obter, mesmo com a complexidade, o mínimo de viés possível, eliminando os fatores externos da manipulação do processo. Assim, espera-se realizar um preparo de biblioteca adequado visando obter os melhores resultados para diminuição do viés na análise de dados que será posteriormente realizada. (AU)

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