Elaboração de bibliotecas para o sequenciamento de alto rendimento e análises primárias de dados.

• Processo: 20/13339-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2020
• Data de Término da vigência: 16 de fevereiro de 2021
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Farmácia
• Pesquisador responsável: Mario Hiroyuki Hirata
• Beneficiário: Beatriz Fernandes
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Farmacêuticas (FCF). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 16/12899-6 - Caracterização genômica, epigenômica e farmacogenômica de portadores de Hipercolesterolemia Familial na população brasileira, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia molecular Biblioteca gênica Sequenciamento de nova geração Fragmentação do DNA Análise de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia Molecular - Sequenciamento - DNA - RNA - Análises - | NGS - Fragmentação - Replicação | Biologia Molecular

Resumo

As novas tecnologias de sequenciamento, denominadas de tecnologias de sequenciamentos de alto rendimento ou de próxima geração (Next Generation Sequencing-NGS), sequenciam o DNA emplataformas capazes de gerar informação sobre milhões de pares de bases em uma única corrida, sendo uma alternativa poderosa para estudos de genômica estrutural e funcional (Carvalho & Silva, 2010; Mardis, 2013).O ponto de partida comum é a preparação das amostras para o sequenciamento que consiste nafragmentação aleatória do DNA e a adição de adaptadores específicos de cada plataforma (Parkinson et al., 2012). A integridade do DNA que será utilizado é de fundamental importância para garantir que a fragmentação seja adequada, já que o tamanho dos fragmentos é um parâmetro chave para a construção da biblioteca (Head et al., 2014). O principal objetivo quando se prepara uma biblioteca é obter, mesmo com a complexidade, o mínimo de viés possível, eliminando os fatores externos da manipulação do processo. Assim, esperase realizar um preparo de biblioteca adequado visando obter os melhores resultados para diminuição do viés na análise de dados que será posteriormente realizada.