Avaliação do papel de regiões regulatórias genômicas em cis nos mecanismos da Epilepsia do Lobo Temporal Mesial associada à Esclerose Hipocampal

• Processo: 20/06168-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2020
• Data de Término da vigência: 31 de agosto de 2025
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Iscia Teresinha Lopes Cendes
• Beneficiário: Jaqueline Cruz Geraldis
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 13/07559-3 - Instituto Brasileiro de Neurociência e Neurotecnologia - BRAINN, AP.CEPID
• Assunto(s): Neurogenética Epilepsia do lobo temporal Esclerose hipocampal Expressão gênica Fatores de transcrição Pegada de DNA Epigenoma Proteômica
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: epilepsia refratária | expressão gênica | integração ômica | Sítios de Ligação de Fatores de Transcrição | Neurogenética

Resumo

A Epilepsia do Lobo Temporal (ELT) é a forma mais comum de Epilepsia em pacientes adultos, sendo que a Epilepsia de Lobo Temporal Mesial (ELTM) é um dos subtipos de ELT que acomete as estruturas mediais do cérebro, como o hipocampo, giro denteado e amigdala. A lesão histopatológica típica na ELTM é a Esclerose Hipocampal (EH), sendo que grande parte dos pacientes com ELTM associada à EH apresenta alta resistência ao tratamento medicamento atualmente disponível. Para esses pacientes, a ressecção cirúrgica do tecido afetado (estruturas mediais afetadas pela lesão tecidual) é uma alternativa de tratamento para controle das crises. Do ponto de vista molecular, pouco ainda se sabe sobre a influência de elementos da regulação genômica em cis presentes nas regiões de cromatina aberta e como as múltiplas vias biológicas influenciadas por estes podem estar interagindo na determinação dos mecanismos básicos que levam à ELTM+EH. A obtenção do espécime cirúrgico permite uma série de investigações sobre o padrão de regulação da expressão gênica nos tecidos de pacientes em comparação com tecido normal. Com este cenário, desenhamos o presente estudo com o objetivo de catalogar e caracterizar os sítios de ligação de fatores de transcrição, em todo o genoma, no tecido cirúrgico obtido de pacientes com ELTM+EH, também chamado de footprint genômico, em comparação com tecido cerebral normal obtido de autópsia. Além disso, faremos uma avaliação deste footprint em diferentes tempos de duração da doença e os correlacionaremos com dados de metiloma e proteômica já obtidos em outros projetos realizados pelo nosso grupo (processos FAPESP 2015/12960-4 e 2017/23954-0). Nosso estudo poderá determinar um panorama mais completo dos mecanismos moleculares que envolvidos na ELTM+EH. Além disso, com nossos resultados esperamos identificar elementos regulatórios e redes de interações moleculares passíveis de modulação medicamentos, contribuindo assim para os esforços que visam melhorar as intervenções terapêuticas para pacientes com formas graves de Epilepsia. Este estudo se insere entre no âmbito do CEPID-BRAINN (www.brainn.org.br) apoiado pela FAPESP (processo # 2013/07559-3). (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BRUXEL, ESTELA M.; BRUNO, DANIELLE C. F.; DO CANTO, AMANDA M.; GERALDIS, JAQUELINE C.; GODOI, ALEXANDRE B.; MARTIN, MARIANA; LOPES-CENDES, ISCIA. Multi-omics in mesial temporal lobe epilepsy with hippocampal sclerosis: Clues into the underlying mechanisms leading to disease. SEIZURE-EUROPEAN JOURNAL OF EPILEPSY, v. 90, n. SI, p. 34-50, AUG 2021. (20/06168-4, 19/25948-3, 18/03254-7, 19/20953-9, 19/00213-0, 17/26167-0)

BRUXEL, ESTELA M.; DO CANTO, AMANDA M.; BRUNO, DANIELLE C. F.; GERALDIS, JAQUELINE C.; LOPES-CENDES, ISCIA. Multi-omic strategies applied to the study of pharmacoresistance in mesial temporal lobe epilepsy. EPILEPSIA OPEN, OCT 2021. (19/25948-3, 20/06168-4, 13/07559-3, 18/03254-7, 17/26167-0)

GALVAO, ISABELLA C.; LEMOINE, MANUELA; MESSIAS, LAUANA A.; ARAUJO, PATRICIA A. O. R. A.; GERALDIS, JAQUELINE C.; YASUDA, CLARISSA L.; ALVIM, MARINA K. M.; GHIZONI, ENRICO; TEDESCHI, HELDER; CENDES, FERNANDO; et al. Multimodal single-cell profiling reveals neuronal vulnerability and pathological cell states in focal cortical dysplasia. ISCIENCE, v. 27, n. 12, p. 20-pg., 2024-12-20. (20/06168-4, 19/07382-2, 13/07559-3, 22/01530-2)