Base genética para a resistência à bactéria Aeromonas hydrophila em populações de Pacu (Piaractus mesopotamicus)

• Processo: 20/11049-4
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de janeiro de 2021
• Data de Término da vigência: 06 de janeiro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Recursos Pesqueiros e Engenharia de Pesca - Aquicultura
• Pesquisador responsável: Fábio Porto-Foresti
• Beneficiário: Vito Antonio Mastrochirico Filho
• Instituição Sede: Faculdade de Ciências (FC). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Bauru. Bauru , SP, Brasil
• Bolsa(s) vinculada(s): 22/09226-0 - Otimização de ferramentas genômicas para investigar assinaturas de resistência em pacu (Piaractus mesopotamicus) à infecção por Aeromonas hydrophila, BE.EP.PD
• Assunto(s): Melhoramento genético animal Biologia computacional Análise de sequência de RNA Marcador molecular Resistência à doença Estudo de associação genômica ampla Aeromonas hydrophila Pacu Piaractus mesopotamicus
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Aquaculture | bioinformatics | BSR-Seq | Disease resistance | Gwas | QTLs | Genética e Melhoramento Animal

Resumo

A seleção de indivíduos com melhor eficiência imunológica contribui para o desenvolvimento de uma Aquicultura economicamente mais vantajosa. A infecção por Aeromonas hydrophila tem sido responsável por cerca de 20 a 30% das mortalidades de Pacu (Piaractus mesopotamicus), uma das mais importantes espécies nativas de peixe cultivadas no Brasil. Análises, como Bulk Segregant RNA-Seq (BSR-Seq), têm possibilitado identificar marcadores moleculares SNPs (Polimorfismos de Nucleotídeo Único) associados a fenótipos resistentes e suscetíveis de indivíduos desafiados por organismos patogênicos, e que podem ser responsáveis por variações na resistência de famílias de peixes submetidas a infecções. O mapeamento de locos de características quantitativas (QTLs) por análise de associação genômica ampla (GWAS), tem tornado possível a dissecação da variabilidade genética, e a localização de regiões genômicas envolvidas no controle da característica de resistência a doenças. O objetivo deste estudo é caracterizar, por meio da técnica BSR-Seq, marcadores moleculares SNPs presentes em genes candidatos que foram diferencialmente expressos após a infecção por A. hydrophila, e que estejam possivelmente relacionados ao desempenho das famílias desafiadas de Pacu. Posteriormente, os SNPs significativamente associados aos fenótipos de resistência serão corroborados por meio da análise GWAS, utilizando dados de genotipagem provenientes de um denso array de SNPs, previamente desenvolvido para o Pacu. SNPs somente serão considerados realmente associados à resistência contra A. hydrophila, quando os mesmos forem detectados em ambas as análises BSR-Seq e GWAS. Os resultados permitirão realizar um mapeamento de alta resolução de potenciais regiões genômicas (QTLs) ligadas à resistência à infecção por A. hydrophila. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MANSO, SHISLEY C. S.; GARCIA, BALTASAR F.; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; PORTO-FORESTI, FABIO; YANEZ, JOSE M.; HASHIMOTO, DIOGO T.. Genomic predictions for resistance to Aeromonas hydrophila in pacu (Piaractus mesopotamicus). Aquaculture, v. 582, p. 7-pg., 2024-01-11. (21/02592-9, 21/14869-5, 20/11049-4, 22/11129-3, 18/08416-5, 22/09226-0)

MASCALI, FLORENCIA CARLA; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO ANTONIO; POSNER, VICTORIA MARIA; RUBIOLO, JUAN ANDRES; HASHIMOTO, DIOGO TERUO; VILLANOVA, GABRIELA VANINA. High-quality genome assembly and annotation of the pacu Piaractus mesopotamicus: an aquatic genetic resource of South American aquaculture. AQUACULTURE INTERNATIONAL, v. 32, n. 7, p. 23-pg., 2024-07-09. (18/08416-5, 16/21011-9, 22/09226-0, 20/11049-4)

MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A.; ARIEDE, RAQUEL B.; FREITAS, V, MILENA; BORGES, CAROLINA H. S.; LIRA, LIESCHEN V. G.; MENDES, NATALIA J.; AGUDELO, JOHN F. G.; CACERES, PABLO; BERROCAL, MILTHON H. M.; SUCERQUIA, GUSTAVO A. L.; et al. Development of a multi-species SNP array for serrasalmid fish Colossoma macropomum and Piaractus mesopotamicus. SCIENTIFIC REPORTS, v. 11, n. 1, SEP 29 2021. (16/21011-9, 17/26900-9, 20/11049-4, 16/18294-9, 18/08416-5, 17/19717-3, 19/10662-7, 19/08972-8)

MASTROCHIRICO-FILHO, VITO ANTONIO; GARCIA, BALTASAR FERNANDES; MANSO, SHISLEY CRISTINA DA SILVA; FREITAS, MILENA VIEIRA; PORTO-FORESTI, FABIO; CACERES, PABLO; YANEZ, JOSE MANUEL; HASHIMOTO, DIOGO TERUO. Assessing accuracy of imputation using different SNP densities as strategy for breeding programs of the fish pacu Piaractus mesopotamicus. AQUACULTURE REPORTS, v. 36, p. 12-pg., 2024-05-18. (22/09226-0, 20/11049-4)