Uso das técnicas de transcriptoma, exoma e expressão gênica para elucidar diferentes fenótipos de distúrbios da diferenciação do sexo em pacientes 46,xy

• Processo: 20/13421-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de maio de 2022
• Área de conhecimento: Ciências da Saúde - Medicina - Clínica Médica
• Pesquisador responsável: Gil Guerra Júnior
• Beneficiário: Helena Fabbri Scallet
• Supervisor: Olaf Hiort
• Instituição Sede: Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Universität zu Lübeck, Alemanha
• Vinculado à bolsa: 18/19445-6 - Uso das técnicas de transcriptoma, exoma e expressão gênica para elucidar diferentes fenótipos de distúrbios da diferenciação do sexo em pacientes 46,xy, BP.PD
• Assunto(s): Endocrinologia pediátrica Transcriptoma Análise de sequência de RNA Diferenciação sexual (núcleo celular)
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: distúrbios da diferenciação do sexo | Nr5A1 | RNA-seq | Sf-1 | Wes | Endocrinologia Pediatrica

Resumo

As condições que apresentam desenvolvimento genital e/ou gonadal incompleto ou desordenado levando a uma discordância entre o sexo genético, gonadal e fenotípico do indivíduo afetado são classificadas como Distúrbios da Diferenciação do Sexo (DDS). São conhecidos diversos genes que atuam nas vias da determinação e diferenciação do sexo, como por exemplo: WT1, SRY, NR5A1, DMRT1, SOX9, GATA4, NR0B1, HAM, AR, SRD5A2, HSD17B3, entre outros. Entretanto, após a triagem em busca de mutações nesses genes, algumas questões importantes se apresentam: nos casos em que variantes foram encontradas, qual o efeito biológico que estas exercem e quais seriam suas reais influencias nos fenótipos? Na tentativa de abordar essas questões frente aos resultados de estudos anteriores, propomos este projeto que será dividido três partes. A primeira será analisar o transcriptoma de material de biopsia de pacientes que apresentam mutações em dois receptores nucleares (AR e NR5A1), a fim de averiguar como estas alterações afetam a regulação de genes, causando um possível desequilíbrio no padrão de expressão genica, e correlacionar os efeitos observados com os diferentes fenótipos apresentados pelos pacientes. Nos casos de mutações no NR5A1, o sequenciamento do exoma (WES) será realizado para procurar por uma segunda variante patogênica que possa explicar os diferentes fenótipos apresentados pelos pacientes. Por último, estudos in vitro por expressão de gene reporter também serão realizados a fim de averiguar o impacto funcional dessas variantes. As análises de bioinformática provenientes dos dados gerados pelo RNA-seq e WES serão realizadas em colaboração com o grupo Medical Systems Biology, enquanto que, os estudos in vitro serão realizados no Department of Pediatric and Adolescent Medicine, Division of Pediatric Endocrinology and Diabetes, ambos na Universidade de Lübeck. O Professor Dr. Olaf Hiort, que será o supervisor responsável, é um dos mais conceituados pesquisadores na área de DDS da Europa. Outros experientes profissionais também irão auxiliar a candidata durante o estágio no exterior, o Professor Dr. Hauke Busch, com as análises de transcriptoma e exoma e Dr. Ralf Werner, com os estudos funcionais. Este trabalho poderá contribuir para uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares que possam explicar o fenótipo dos pacientes, bem como, servira para implementar os estudos de exomas e transcriptomas em nosso laboratório. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

CALONGA-SOLIS, VERONICA; FABBRI-SCALLET, HELENA; OTT, FABIAN; AL-SHARKAWI, MOSTAFA; KUENSTNER, AXEL; WUNSCH, LUTZ; HIORT, OLAF; BUSCH, HAUKE; WERNER, RALF. MYRF: A New Regulator of Cardiac and Early Gonadal Development-Insights from Single Cell RNA Sequencing Analysis. JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE, v. 11, n. 16, p. 12-pg., 2022-08-01. (20/13421-8)