| Processo: | 20/14158-9 |
| Modalidade de apoio: | Bolsas no Brasil - Doutorado |
| Data de Início da vigência: | 01 de maio de 2021 |
| Data de Término da vigência: | 23 de maio de 2025 |
| Área de conhecimento: | Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica |
| Pesquisador responsável: | Pedro Alexandre Favoretto Galante |
| Beneficiário: | Filipe Ferreira dos Santos |
| Instituição Sede: | Hospital Sírio-Libanês. São Paulo , SP, Brasil |
| Bolsa(s) vinculada(s): | 23/07144-0 - Panorama geral do transcriptoma das proteínas de membrana celular humana ao longo dos estágios de neurodesenvolvimento de modelos de organóides cerebrais, BE.EP.DR |
| Assunto(s): | Biologia computacional Isoformas de proteínas Proteínas da membrana Biomarcadores tumorais Prognóstico Neoplasias Terapia de alvo molecular |
| Palavra(s)-Chave do Pesquisador: | Aprendizagem de Maquina | Banco de dados | câncer | Proteinas de membrana | Splicing alternativo | terapia molecular alvo | Bioinformática |
Resumo O splicing é um passo essencial da expressão gênica em eucariotos. Muitos loci do genoma humano, após serem transcritos, são processados de maneira alternativa (splicing alternativo), gerando diferentes isoformas de mRNAs para um mesmo gene (locus). Sabe-se que alterações no padrão de splicing estão relacionadas ao desenvolvimento de aproximadamente 15% das doenças genéticas e, claro, a diversos tipos de tumores malignos em humanos. Células cancerígenas, de maneira geral, apresentam uma alta taxa de splicing alternativo, inclusive com isoformas específicas de tumores. Neste projeto, iremos buscar eventos de splicing alternativo em genes codificadores de proteínas de membrana celular que ocorrem de maneira específica ou preferencial em amostras tumorais. Para isso, utilizaremos dados de expressão gênica de um conjunto de ~11.000 amostras de 33 tipos de Cânceres e um amplo repertório de ferramentas computacionais (de bioinformática) para processar, integrar e analisar esses dados. Como selecionaremos somente aquelas isoformas específicas ou preferenciais de tumores e eventos em genes codificadores para proteínas de membrana celular, esperamos, no final deste projeto, ter um conjunto promissor de biomarcadores para o desenvolvimento deliberado de novas terapia-alvo para o tratamento do Câncer. Nas nossas análises, iremos dar uma atenção especial àqueles Cânceres que ainda não possuem boas opções de tratamento, tais como o Glioblastoma, o Glioma Difuso de Ponte Pediátrico e o Adenocarcinoma de Pâncreas, para o qual inclusive já temos resultados preliminares promissores. Todos os resultados aqui gerados serão organizados em um banco de dados de livre acesso e divulgados para a comunidade científica. Em conclusão, esperamos que nossos achados ajudem no desenvolvimento de novas terapia-alvo para o Câncer, sobretudo para aqueles tumores com alta taxa de mortalidade e que ainda não possuem boas drogas alvo ou tratamentos altamente eficazes. (AU) | |
| Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa: | |
| Mais itensMenos itens | |
| TITULO | |
| Matéria(s) publicada(s) em Outras Mídias ( ): | |
| Mais itensMenos itens | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |
| VEICULO: TITULO (DATA) | |