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Caracterização virológica de isolados brasileiros de SARS-CoV-2 e estudo da variação de sequência e os padrões evolutivos da proteína Spike específicos para avaliar o potencial de escape da vacina por modificação do alvo ou epítopos

Processo: 21/05661-1
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
Vigência (Início): 01 de julho de 2021
Vigência (Término): 30 de junho de 2023
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Pesquisador responsável:Luiz Mário Ramos Janini
Beneficiário:Robert Andreata Santos
Instituição-sede: Escola Paulista de Medicina (EPM). Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP). Campus São Paulo. São Paulo , SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:20/08943-5 - Investigação de elementos induzidos pela resposta vacinal nos indivíduos submetidos aos testes clínicos com a vacina ChAdOx1 nCOV-19, AP.TEM
Assunto(s):Virologia   Vetores virais   SARS-CoV-2   COVID-19   Vacinas contra COVID-19   Vacina ChAdOx1 nCoV-19   Glicoproteína da espícula de Coronavirus   Biobancos e biorrepositórios   Transcriptoma   Análise de sequência de RNA   Resposta imune

Resumo

Esta proposta de pesquisa consiste em um desdobramento do projeto internacional com amostras de indivíduos voluntários para o teste da vacina Oxford-UNIFESP ChAdOx1 nCoV-19. A proposta envolverá as 2.000 amostras de voluntários, e os períodos correspondentes, e será responsável por compor o Biobanco da instituição-sede para toda a comunidade acadêmica do Estado de São Paulo. Além disso, as amostras armazenadas no Biobanco serão usadas para realizar análises que não se sobrepõem às "Medidas de resultados primários e secundários", conforme descrito na documentação do ensaio clínico disponível em ClinicalTrials.gov (Institutos Nacionais de Saúde, ID NCT04400838). O projeto será coordenado pelo Prof. Luiz Mario Ramos Janini e incluirá uma equipe de pesquisadores principais em diferentes áreas, referentes aos objetivos específicos e histórico de pesquisa da FAPESP. Os objetivos deste projeto são: (1) armazenar e disponibilizar todas as amostras obtidas de voluntários antes e depois da vacinação no Biobanco da UNIFESP. Esse Biobanco foi construído de acordo com os procedimentos legais, com o objetivo de armazenar corretamente e disponibilizar amostras para toda a comunidade científica do Estado de São Paulo, nacional e internacional; (2) avaliar a capacidade de neutralização de soros de indivíduos vacinados contra isolados de SARS-CoV-2 circulantes específicos do Brasil e outros isolados específicos de coronavírus para avaliação da imunidade cruzada; (3) caracterizar isolados brasileiros de SARS-CoV-2 e estudar a variação de sequência e os padrões evolutivos da proteína "Spike" específicos para avaliar o potencial de escape da vacina por modificação do alvo ou epítopos; (4) gerar e analisar perfis de citocinas de soros de voluntários antes e após a vacinação para avaliar a resposta inflamatória e efeitos associados; (5) analisar e comparar os transcriptomas sanguíneos de voluntários, por RNA-seq, antes e após a vacinação. Essa análise será quantitativa e qualitativa para avaliar o impacto da vacina nos níveis diferenciais de expressão gênica e avaliara variação individual na resposta genética à vacina e (6) analisar o perfil de secretoma no sangue total dos voluntários, antes e após a vacinação, para avaliar o tipo de resposta imune predominante e possível "priming" por outro coronavírus. (AU)

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Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ANDREATA-SANTOS, ROBERT; JANINI, LUIZ M. R.; DURAES-CARVALHO, RICARDO. From Alpha to Omicron SARS-CoV-2 variants: What their evolutionary signatures can tell us?. Journal of Medical Virology, . (19/01255-9, 21/03684-4, 21/05661-1, 20/08943-5)

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