Apoio e supervisão de bioinformática para o projeto Escalas da Biodiversidade

• Processo: 21/09643-8
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Programa Capacitação - Treinamento Técnico
• Vigência (Início): 01 de setembro de 2021
• Vigência (Término): 31 de agosto de 2023
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Genética
• Acordo de Cooperação: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
• Pesquisador responsável: Inácio de Loiola Meirelles Junqueira de Azevedo
• Beneficiário: Vinicius Carius de Souza
• Instituição Sede: Instituto Butantan. Secretaria da Saúde (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 16/50127-5 - Dimensions US-BIOTA São Paulo: scales of biodiversity: integrated studies of snake venom evolution and function across multiple levels of diversity, AP.BTA.TEM
• Assunto(s): Biologia computacional Transcriptômica Genômica Venenos Venenos de serpentes Banco de dados
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Genômica | Gerenciamento de dados | Transcriptômica | Bioinformática

Resumo

O projeto Escalas da Biodiversidade tem como objetivo direto a resolução de questões fundamentais acerca do papel desempenhado pelo veneno na evolução de serpentes, e vice-versa. Para isso, vem sendo construída uma rica base de dados moleculares (genômicos, transcriptômicos e proteômicos) de serpentes do Novo Mundo, que não encontra paralelo em outro lugar. No momento, a base contém dados transcriptômicos de 120 espécies de serpentes de todas as famílias produtoras de veneno nas Américas, gerados de forma padronizada e cobrindo diversos tecidos, além de alguns genomas sequenciados e da corroboração proteômica da composição de dezenas de venenos. Assim, faz-se necessário o apoio de profissional com conhecimentos em bioinformática e genética para lidar com a grande quantidade de dados gerados, auxiliando o trabalho de alunos e pesquisadores. O Técnico selecionado deverá realizar o gerenciamento do banco de dados moleculares, atualizando-o com novos dados gerado e realizando o processo de análise básica estabelecido nos últimos anos. Especificamente também deverá auxiliar nos processos de montagem genômica, testando softwares e desenvolvendo scripts e tutoriais para essa finalidade. A depender do desempenho e aprendizado, poderá se envolver em projetos específicos de uso dos dados gerados. (AU)