Análise sistemática comparativa de transcriptomas na elucidação de potenciais alvos antifúngicos

• Processo: 21/10359-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de novembro de 2021
• Data de Término da vigência: 31 de outubro de 2025
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Molecular e de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Nilce Maria Martinez-Rossi
• Beneficiário: Monise Fazolin Petrucelli
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 19/22596-9 - Mecanismos moleculares associados à patogenicidade e resistência em fungos: estratégias para o tratamento de dermatofitoses, AP.TEM
• Assunto(s): Biologia molecular Dermatófitos Transcriptoma Antifúngicos Neurospora crassa Trichophyton rubrum Desenvolvimento de fármacos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: alvos de fármacos | dermatófito | Transcriptoma | Biologia Molecular de dermatófitos

Resumo

Modelos computacionais que objetivam a identificação sistemática de potenciais alvos antifúngicos foram utilizados com sucesso para fungos como Aspergillus fumigatus e leveduras, e evidenciam o potencial uso de sequenciamento em larga escala com esta finalidade. O genoma de diversos fungos patogênicos, incluindo os dermatófitos, é conhecido e contribui fortemente para as análises comparativas e a identificação de classes de genes enriquecidas no genoma de espécies ou grupos de fungos específicos e que estão associadas à adaptação a determinado nicho e ao estilo de vida desses fungos. Além da análise comparativa de genomas, as abordagens correntemente empregadas para a identificação de alvos moleculares putativos avaliam o fluxo metabólico, compilam dados sobre a expressão dos genes em condições específicas e estabelecem um "ranking" para alvos promissores, que também leva em consideração as análises dos domínios, estrutura tridimensional de proteínas e comparação com as proteínas ortólogas de humanos. Adicionalmente, o estudo sistemático das redes metabólicas pode requerer um estudo comparativo de linhagens, empregando a análise de coleções de mutantes. Nesta proposta pretende-se identificar nos dados gerados nos transcriptomas das linhagens de selvagem e mutantes de N. crassa e T. rubrum enzimas cruciais para o metabolismo e adaptação dos fungos frente às diferentes condições de cultivo, revelando de forma refinada alvos moleculares para o desenvolvimento de antifúngicos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

MARTINS-SANTANA, LEONARDO; PETRUCELLI, MONISE FAZOLIN; SANCHES, PABLO R.; ALMEIDA, FAUSTO; MARTINEZ-ROSSI, NILCE M.; ROSSI, ANTONIO. The StuA Transcription Factor and Alternative Splicing Mechanisms Drive the Levels of MAPK Hog1 Transcripts in the Dermatophyte Trichophyton rubrum. Mycopathologia, v. 189, n. 3, p. 14-pg., 2024-06-01. (19/22596-9, 21/10255-2, 21/10359-2)

PETRUCELLI, MONISE FAZOLIN; MARTINS-SANTANA, LEONARDO; OLIVEIRA, VANDERCI M.; SANCHES, PABLO R.; ROSSI, ANTONIO; MARTINEZ-ROSSI, NILCE M.. The Transcription Factor StuA Regulates Oxidative Stress-Responsive Genes in Trichophyton rubrum. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, v. 25, n. 23, p. 16-pg., 2024-12-01. (21/10359-2, 19/22596-9, 21/10255-2)