Estudo de associação genômica ampla (GWAS) e genômica funcional da resistência parasitária em ovinos da raça Morada Nova

• Processo: 21/11842-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Data de Início da vigência: 01 de agosto de 2022
• Data de Término da vigência: 28 de fevereiro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
• Pesquisador responsável: Simone Cristina Méo Niciura
• Beneficiário: Simone Cristina Méo Niciura
• Pesquisador Anfitrião: Cedric Gondro Msu
• Instituição Sede: Embrapa Pecuária Sudeste. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). São Carlos , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: Michigan State University (MSU), Estados Unidos
• Assunto(s): Biologia computacional Haemonchus contortus Seleção animal Transcriptoma Integração de dados Ovelha Morada Nova
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Genotipagem em chip | Haemonchus contortus | integração de dados | selecao animal | Transcriptoma | Resistência Parasitária

Resumo

Morada Nova é uma raça ovina deslanada nativa brasileira e bastante adaptada ao clima tropical. Animais Morada Nova apresentam diversas características de interesse econômico, com destaque à ótima performance reprodutiva e à alta resistência aos nematoides gastrintestinais. No cenário mundial de resistência anti-helmíntica múltipla, a seleção animal para a resistência parasitária constitui interessante estratégia para minimizar perdas econômicas na ovinocultura. Dentre os parasitas de ovinos, Haemonchus contortus, helminto hematófago de abomaso, é o nematoide mais prevalente e patogênico e que leva desde problemas sanitários e perdas produtivas, a anemia e morte. Dessa maneira, a seleção de ovinos resistentes a nematoides pode trazer grandes benefícios aos programas de melhoramento animal. Considerando a natureza quantitativa dessa característica, abordagens genômicas, especialmente estudos de associação genômica ampla (GWAS), são mais adequadas para investigar a arquitetura genética da resistência parasitária em comparação a estratégias de genes candidatos. Nesse sentido, serão utilizados dados de 287 cordeiros da raça Morada Nova submetidos a duas infecções artificiais com H. contortus e avaliados por meio da contagem de ovos por grama de fezes (OPG), do volume globular (VG) e do ganho de peso. Após ranqueamento e seleção dos animais com fenótipos extremos, 48 ovinos foram genotipados com o chip Illumina OvineSNP50v3, e o tecido abomasal coletado de 10 animais com fenótipos extremos foi destinado a RNA-seq. O objetivo desta proposta é realizar GWAS e integrar dados genômicos e transcriptômicos para identificação de marcadores e alterações funcionais associados à resistência a H. contortus em ovinos. Essas informações podem ser úteis para a seleção animal, para o controle de nematoides gastrintestinais em rebanhos e para a elucidação de mecanismos biológicos moleculares associados à resistência parasitária em ovinos. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

SIMONE CRISTINA MÉO NICIURA; GUILHERME MARTINELI SANCHES. Predição de resistência anti-helmíntica múltipla por aprendizado de máquina e controle da verminose em rebanhos ovinos. Revista Brasileira de Parasitologia Veterinária, v. 33, n. 1, 2024-03-18. (21/02535-5, 21/11842-9)