Caracterização molecular de patógenos respiratórios aviários através do sequenciamento de alto desempenho (NGS)

• Processo: 20/07292-0
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Pesquisa
• Data de Início da vigência: 04 de fevereiro de 2022
• Data de Término da vigência: 28 de agosto de 2022
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Medicina Veterinária - Medicina Veterinária Preventiva
• Pesquisador responsável: Renato Luís Luciano
• Beneficiário: Renato Luís Luciano
• Pesquisador Anfitrião: Rodrigo Gallardo
• Instituição Sede: Instituto Biológico (IB). Agência Paulista de Tecnologia dos Agronegócios (APTA). Secretaria de Agricultura e Abastecimento (São Paulo - Estado). São Paulo , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of California, Davis (UC Davis), Estados Unidos
• Vinculado ao auxílio: 17/50334-3 - Plano de Desenvolvimento Institucional em Pesquisa (PDIp): modernização e adequação de unidades multiusuárias estratégicas do Instituto Biológico, AP.PDIP
• Auxílio(s) vinculado(s): 24/05594-0 - 2024 American Association of Avian Pathologists Annual Meeting, AR.EXT
• Assunto(s): Avicultura Biologia computacional Técnicas de diagnóstico molecular Genômica Sequenciamento de nova geração Virologia
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bioinformática | Diagnóstico Molecular | Genômica | Ngs | Patógenos Respiratórios Aviários | sequenciamento de alto desempenho | Virologia

Resumo

A avicultura industrial desempenha um papel fundamental na economia nacional. Atualmente, o Brasil é o principal exportador e o terceiro maior produtor mundial de carne de frango. As doenças respiratórias são responsáveis por inúmeros prejuízos na avicultura industrial, interferindo diretamente no agronegócio. As principais enfermidades respiratórias são influenza aviária (IA), doença de Newcastle (DNC), doenças de notificação obrigatória ao serviço veterinário oficial. Outras enfermidades possuem o caráter endêmico, tais como bronquite infecciosa das galinhas (VBI) e a coriza infecciosa (CI), sendo controladas com utilização de vacinas, além de medidas de biosseguridade associadas. Doenças respiratórias em aves de produção podem ser multifatoriais, sendo ocasionadas, às vezes, por diversos patógenos. Os sinais clínicos ocasionados pelas enfermidades respiratórias são muito semelhantes, sendo necessário realizar o diagnóstico diferencial e conclusivo do(s) agente(s) etiológico(s) envolvido(s). No Brasil, o Programa Nacional de Sanidade Avícola (PNSA) do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (MAPA) estabeleceu a legislação para o controle de IA e DNC com a finalidade de reduzir o risco de introdução e disseminação dos agentes envolvidos. O Centro Avançado de Pesquisa Avícola (CEAV), do Instituto Biológico, localizado em Descalvado - SP, é um laboratório credenciado para o diagnóstico molecular oficial de IA e DNC, integrando a rede de apoio laboratorial do MAPA, além de realizar diversos diagnósticos para empresas avícolas. O objetivo deste projeto é realizar a caracterização molecular de enfermidades respiratórias de importância na avicultura através da técnica de NGS, com a finalidade de ampliar o conhecimento epidemiológico de agentes, tais como vírus de IA (VIA), vírus da DNC (VDNC), vírus da BI (VBI) e Avibacterium paragallinarum, bactéria causadora da CI, além de realizar a diferenciação entre estirpes vacinais e de campo, no caso das doenças controladas com vacinação. Para tanto, está sendo solicitada uma Bolsa de Pesquisa no Exterior, com a finalidade de realizar treinamento sob a supervisão do Dr. Rodrigo A. Gallardo (Department of Population Health and Reproduction - School of Veterinary Medicine - University of California - Davis - USA), professor responsável por projetos de caracterização molecular de patógenos aviários, sendo o pesquisador líder do Poultry Medicine Lab e co-responsável pelo Feed the Future Innovation Lab for Genomics in Poultry (USAID). É pesquisador principal dos projetos "Infectious coryza: Typing and vaccine protection studies" (Merck Animal Health and Elanco Animal Health), "Discovering innate responses to infectious bronchitis virus" (CFAH/USDA/NIFA) e "False layer syndrome caused by IBV in layers, characterization and pathobiology" (Merck Animal Health). Durante o período de estágio no exterior, iremos conduzir pesquisas relacionadas às análises genômicas e de bioinformática das sequências dos genomas completos provenientes de agentes etiológicos responsáveis por enfermidades respiratórias de importância na avicultura. Os resultados permitirão compreender de uma forma mais ampla a utilização de ferramentas moleculares e a epidemiologia destes agentes, contribuindo para aprimorar as estratégias de prevenção e controle dessas doenças nos plantéis avícolas. (AU)