Uma abordagem de engenharia do sistema de transporte de Saccharomyces cerevisiae para expandir o repertório de absorção de açúcar de uma cepa industrial empregando as tecnologias CRISPR/Cas e evolução direta.

• Processo: 21/13808-2
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
• Data de Início da vigência: 28 de março de 2022
• Data de Término da vigência: 27 de março de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Bioquímica - Bioquímica de Microorganismos
• Pesquisador responsável: Roberto do Nascimento Silva
• Beneficiário: Karoline Maria Vieira Nogueira
• Supervisor: Hal Samuel Alper
• Instituição Sede: Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Texas at Austin (UT), Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 18/25898-3 - Engenharia genética e metabólica de uma linhagem industrial de Saccharomyces cerevisiae para o transporte e co-fermentação de xilose e celobiose visando aprimoramento do processo de produção de etanol a partir do bagaço de cana-de-açúcar, BP.PD
• Assunto(s): Biologia molecular Repetições palindrômicas curtas agrupadas e regularmente espaçadas Saccharomyces cerevisiae Bioetanol Fungos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Cas | Crispr | Direct evolution | Saccharomyces cerevisiae | Second-generation ethanol | Sugar transporters | Transporter engineering | Bioquímica e Biologia Molecular de Fungos

Resumo

No processo de produção de etanol de segunda geração (etanol 2G), a hidrólise enzimática da biomassa lignocelulósica libera uma mistura de açúcares, incluindo hexoses (por exemplo, glicose), pentoses (por exemplo, xilose) e celodextrinas (por exemplo, celobiose). Durante a etapa de fermentação, o transporte desses açúcares para o interior da célula da levedura é a primeira e crítica etapa para permitir a produção microbiana de etanol. Uma das principais limitações desse processo é que Saccharomyces cerevisiae carece de um sistema de transporte de açúcar (STS) eficiente, capaz de internalizar outros açúcares citados acima, além da glicose, e não é capaz de metabolizá-los. Para superar esses gargalos, esta proposta visa desenvolver leveduras capazes de internalizar e co-fermentar xilose e celobiose de forma eficiente. Como a maioria dos transportadores de açúcar nativos derivados de diferentes microrganismos apresentam uma ampla variedade de substratos e / ou baixa atividade, será empregada uma abordagem de evolução direta para obtenção de transportadores de xilose (GXF1 de Candida intermedia e Cs4130 de Candida sojae) e transportadores de celobiose (Tr69957 de Trichoderma reesei e CDT-2 de Neurospora crassa), com especificidade e atividade otimizadas frente a esses açúcares. Em seguida, o sistema CRISPR/cas9 será empregado para realizar modificações genéticas na cepa industrial S. cerevisiae Pedra-2 (PE-2), incluindo as vias metabólicas de xilose e celobiose, juntamente com os transportadores de açúcar mutados. Posteriormente, uma biblioteca baseada em plasmídeo acoplada a um sistema de modulação baseado em CRISPR-dCas9 será aplicado para selecionar novos genes alvo visando beneficiar a co-fermentação de celobiose/xilose por S. cerevisiae. Por fim, será analisado o desempenho fermentativo da cepa resultante. Ao final deste trabalho, será obtida uma cepa PE-2 modificada capaz de co-fermentar celobiose e xilose de maneira eficiente, evidenciando a engenharia do STS como uma estratégia crucial para o aprimoramento de cepas industriais. (AU)

Publicações científicas

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

BOWMAN, EMILY K. K.; HOANG, PHUONG T. NGUYEN T.; SIERRA, ANGELA R. GORDILLO R.; NOGUEIRA, KAROLINE M. VIEIRA M.; ALPER, HAL S. S.. Temporal sorting of microdroplets can identify productivity differences of itaconic acid from libraries of Yarrowia lipolytica. LAB ON A CHIP, v. 23, n. 9, p. 8-pg., 2023-03-30. (21/13808-2)