Montagem do genoma de alta qualidade a partir de leituras curtas e longas de uma abelha sem ferrão brasileira ameaçada de extinção

• Processo: 22/00844-3
• Modalidade de apoio: Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Doutorado
• Data de Início da vigência: 31 de agosto de 2022
• Data de Término da vigência: 27 de fevereiro de 2023
• Área de conhecimento: Ciências Biológicas - Genética - Genética Animal
• Pesquisador responsável: Maria Imaculada Zucchi
• Beneficiário: Patricia Azevedo
• Supervisor: Matthew Hudson
• Instituição Sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas , SP, Brasil
• Instituição Anfitriã: University of Illinois at Urbana-Champaign, Estados Unidos
• Vinculado à bolsa: 18/24245-6 - Genômica, transcriptômica e metagenômica em populações de abelhas nativas sem ferrão visando a busca de genes de detoxificação, BP.DR
• Assunto(s): Biologia computacional Genomas Abelhas-sem-ferrão Melipona scutellaris Espécies em perigo de extinção Polinização Tecnologias de aplicação de agrotóxicos
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: bees genetics | hybrid assembly | Illumina sequencing | insects genome | PacBio sequencing | Bioinformática

Resumo

A abelha sem ferrão brasileira Melipona scutellaris realiza uma polinização específica, a polinização por vibração, e é uma espécie chave que poliniza culturas economicamente importantes. No entanto, apesar de sua importância, a população de M. scutelarris está diminuindo tanto em número quanto em distribuição original, colocando-os na lista vermelha de espécies ameaçadas de extinção do ICMBio. Uma das principais causas desse declínio é o uso exacerbado de agrotóxicos, uma vez que o Brasil está entre os maiores consumidores de agrotóxicos do mundo. Pelo exposto, as estratégias de conservação desta espécie de abelha são importantes para os serviços ecossistêmicos e o bem-estar humano. A genômica da conservação tem sido muito explorada, principalmente com a evolução das tecnologias de armazenamento, processamento, análise e sequenciamento de dados. Além disso, a combinação de leituras longas e curtas fornece genomas de qualidade e pode melhorar muito o número de conjuntos de genomas de insetos. Portanto, a presente proposta de estágio no exterior contribuirá para o treinamento em montagem de genoma de insetos utilizando e comparando diferentes ferramentas de montagem de genoma, bem como programas de anotação e identificação de genes ortólogos. Além disso, os genes de M. scutellaris serão comparados com os genes de A. mellifera buscando diferenças nos genes de desintoxicação. (AU)